Wat is het verschil tussen genmapping en gensequencing
Share
De grootste verschil tussen genmapping en gensequencing is dat het gen mapping identificeert de locus van genen en hun relatieve afstand in het genoom terwijl de gensequencing de volgorde van de nucleotiden aangeeft, die de genen in het genoom vormen. Bovendien resulteert het in kaart brengen van genen in een minder gedetailleerd resultaat, terwijl gensequencing resulteert in een volledig gedetailleerde uitkomst.
Genmapping en gensequencing zijn twee soorten genoomanalysemethoden die helpen om verschillende soorten informatie over genomen te verkrijgen.
Key Areas Covered
1. Wat is Gen Mapping
- Definitie, methode, belang
2. Wat is Gene Sequencing
- Definitie, methode, belang
3. Wat zijn de overeenkomsten tussen genmapping en gensequencing
- Overzicht van gemeenschappelijke functies
4. Wat is het verschil tussen genmapping en gensequencing
- Vergelijking van belangrijke verschillen
Sleutelbegrippen
Gen Mapping, Gen Sequencing, Locus, Nucleotide Sequence, Physical Mapping, Relative Distance
Wat is Gen Mapping
Gen-mapping is de identificatie van de locus van genen en hun relatieve afstand in het genoom. Vandaar dat een genmap een reeks herkenningspunten bevat van korte DNA-sequenties of regulerende sites, die genen inschakelen en uitschakelen. Het is dus een eendimensionale kaart, die lineair is. Ook worden de genen of de andere belangrijke sequenties in een genkaart genoemd met letters en cijfers; bijvoorbeeld D14S72 en GATA-P7042. Verder is de meeteenheid van de afstand tussen twee genen centimorgan. Eén centimorgan is gelijk aan het percentage van twee onafhankelijk geërfde genen. Het helpt om een bepaald genoom te verkennen en om door het genoom te navigeren. Het helpt ook om nieuwe genen in het genoom te identificeren.
Figuur 1: Gene Map in Drosophila
Gene mapping stelt de wetenschappers in staat om de genen te identificeren die bij ziekten zijn betrokken. Hiervoor kunnen ze het genoom van de families die getroffen zijn door een bepaalde ziekte in kaart brengen. Hier worden de andere herkenningspunten die dicht bij de ziekteveroorzakende genen liggen, markers voor dat specifieke gen. De identificatie van dergelijke herkenningspunten helpt om de exacte locatie van het ziekte veroorzakende gen in het genoom te identificeren. Dit zal dus de grootte van het te onderzoeken DNA-stuk uit het hele genoom beperken. Vervolgens kunnen de wetenschappers de geselecteerde reeks oriëntatiepunten met dezelfde oriëntatiepunten van gezonde personen testen om het exacte gen gerelateerd aan de ziekte te identificeren. Zodoende kan genmapping de genen identificeren die verantwoordelijk zijn voor ziekten zoals de ziekte van Huntington, cystische fibrose, enz.
Wat is Gene Sequencing
Gensequencing is een geavanceerdere methode dan het in kaart brengen van genen. Het identificeert elk en elk nucleotide in een bepaald stuk DNA. Daarom, omdat het tot op het nucleotide niveau van DNA onthult, kan gensequencing meer gedetailleerde informatie over het genoom geven. Verder ingaan op de methoden van gensequencing; de belangrijkste methode voor het bepalen van genen is het sequencen van het shotgun. Hier maakt de verbrijzeling van het genoom in kleine fragmenten de karakterisering van elk fragment mogelijk. Vervolgens worden de sequenties van elk fragment samengevoegd om de gehele sequentie van het genoom te verkrijgen.
Figuur 2: Verschil tussen genmapping en gensequencing
Hoewel gensequencing volledig een ander proces is, lijkt het op het proces van fysieke mapping. Fysieke mapping en gen-mapping zijn de twee soorten genoom-mapping. Bij fysische mapping levert de restrictiedigestie van het genoom korte fragmenten op, die vervolgens worden geanalyseerd. De uiteindelijke fysieke kaart wordt gemaakt door alle beperkingsfragmenten samen te voegen. Fysieke toewijzing kan echter geen gedetailleerd resultaat geven, zoals gensequencing.
Overeenkomsten tussen genmapping en gensequencing
- Gen-mapping en gensequencing zijn twee methoden voor het analyseren van het genoom.
- Ze bieden informatie over de locatie van genen.
- Beide methoden hebben ook voordelen bij het bepalen van ziekteveroorzakende genen in het genoom.
Verschil tussen genmapping en gensequencing
Definitie
Genmapping verwijst naar het in kaart brengen van de posities van genen op een DNA-molecuul of chromosoom en de afstand, in koppelingseenheden of fysieke eenheden tussen genen, terwijl gensequencing verwijst naar het proces van het vaststellen van de sequentie van nucleotiden in een segment van DNA. Dit verklaart dus het belangrijkste verschil tussen genmapping en gensequencing.
Betekenis
Een ander verschil tussen gen-mapping en gensequencing is dat de gen-mapping de oriëntatiepunten van het genoom identificeert, terwijl gensequencing de sequentie van nucleotiden in het genoom beschrijft.
gedetailleerdheid
Ook verschaft de uitkomst van de genafbeelding minder details, terwijl de uitkomst van de sequentiebepaling van genen volledig gedetailleerd is. Dit is ook een groot verschil tussen genmapping en gensequencing.
Tijd en de kosten
Het in kaart brengen van genen is echter een goedkope methode, die minder tijdrovend is, terwijl gensequencing een dure methode is, die tijd kost..
Conclusie
Gene mapping is een methode voor het identificeren van oriëntatiepunten zoals genen en hun regulerende sequenties in het genoom. Om precies te zijn, geeft het de exacte locatie van deze oriëntatiepunten in het genoom en hun relatieve afstanden. Aan de andere kant is gensequencing een geavanceerde methode voor het analyseren van het genoom, die alle nucleotiden van het genoom en hun volgorde van verschijning beschrijft. Daarom is het belangrijkste verschil tussen genmapping en gensequencing de gedetailleerdheid van de informatie die ze bieden.
Referentie:
1. "KAART VAN GENOME." GNN - Genome News Network, J. Craig Venter Institute, 15 januari 2003, hier beschikbaar
Afbeelding met dank aan:
1. "Drosophila Gene Linkage Map" door Twaanders17 - Eigen werk (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia
2. "NHGRI Fact Sheet-Genetic Mapping (27058469495)" door National Human Genome Research Institute (NHGRI) uit Bethesda, MD, VS - NHGRI-gegevensblad: Genetic Mapping (CC BY 2.0) via Commons Wikimedia
