Hoe aminozuursequentie te vinden

Wat is aminozuur

Aminozuren zijn de basisbouwstenen van alle eiwitten in ons lichaam. Mag het een hormoon, een enzym, een structureel eiwit zoals keratine zijn, allemaal zijn deze opgebouwd uit aminozuren. Aminozuren polymeriseren om eiwitten te produceren. Omdat elk aminozuur een basisch -NH2-uiteinde en een zuur -COOH-uiteinde heeft, reageren deze uiteinden met elkaar waardoor een keten van aminozuren wordt gevormd die een polypeptide wordt genoemd. Een polypeptide kan een verscheidenheid aan aminozuren bevatten. Afhankelijk van de volgorde van aminozuren, ook wel de aminozuursequentie genoemd, kunnen eiwitten van elkaar verschillen. De volgorde is van het grootste belang omdat het bepaalt of het eiwit goed functioneert of niet.

Aminozuren polymeriseren niet willekeurig. Dit proces is sterk gereguleerd. De code van elk eiwit wordt opgeslagen in een DNA-sequentie die eerst wordt getranscribeerd naar een m-RNA-sequentie (in hogere organismen wordt DNA gesplitst vóór conversie naar m-RNA waarbij de ongewenste DNA-sequenties die tussen genen liggen) worden verwijderd) en vervolgens m- RNA wordt vertaald in een aminozuursequentie. 

(A = Adenine, T = Thymine, G = Guanine, C = Cytosine, U = Uracil in m-RNA t is vervangen door U)

Als we DNA beschouwen als een vierletterig alfabet en het kan drieletterwoorden zijn, worden deze drieletterwoorden codons genoemd. Elk van deze codons staat voor een bepaald aminozuur. Daarom, als een DNA-sequentie of m-RNA-sequentie wordt verschaft, kunnen we mogelijk de aminozuursequentie voorspellen. Het echte probleem is dat DNA een lineaire reeks informatie is. We zouden regels moeten hebben om op de juiste positie te starten en te stoppen.

Weinig stappen om aminozuursequentie te vinden

• STAP 1  - Weet welke DNA-streng wordt gegeven. Er zijn twee strengen: coderingsstreng of niet-coderende streng.

 

Men kan de coderende streng lezen van 3 'naar 5' of de matrijsstreng lezen van 5 'naar 3' bij het maken van de overeenkomstige m-RNA streng.

• STAP 2 - Schrijf de corresponderende m-RNA-streng.

Coderingstekst gebruiken: (A = U, T = A, G = C, C = G) Lezen van links naar rechts

Template-streng gebruiken: (T = U) Lezen van links naar rechts

We kunnen zien dat we dezelfde volgorde bereiken, ongeacht de gebruikte streng.

• STAP 3 - Converteer m-RNA als een sequentie van codons. Begin ALTIJD met het codon AUG en tel NOOIT hetzelfde nucleotide tweemaal!

• STAP 4 - Gebruik de onderstaande tabel om de relevante aminozuursequentie te vinden.

Onthoud ook,
een. Startcodon AUG staat voor Methionine.
b. Als u een stopcodon UAA, UGA of UAG tegenkomt, moet u de sequencing stopzetten.

Controleer of u het onderstaande antwoord krijgt:

Met- Leu- Asp- Val- Phe-STOP