Verschil tussen repetitief DNA en satelliet-DNA

Belangrijkste verschil - Repeterend DNA versus satelliet-DNA

Repeterend DNA en satelliet-DNA zijn twee soorten DNA die worden gevonden in het genoom van de meeste eukaryoten. De grootste verschil tussen repetitief DNA en satelliet-DNA is dat repetitief DNA is een kleine DNA-reeks die honderden of duizenden keren wordt herhaald, terwijl satelliet-DNA zeer repetitieve DNA-sequenties is, die een aanzienlijk deel van het genoom vormen. De twee typen herhalingen in het genoom zijn tandemherhalingen en herhalende herhalingen. Satelliet-DNA bestaat uit vele tandem-herhalingen van een korte basisherhalende eenheid. Het bevindt zich op specifieke chromosomen van het menselijk genoom en in de buurt van de centromeren van de chromosomen.

Key Areas Covered

1. Wat is Repetitive DNA
     - Definitie, vetten, soorten
2. Wat is satelliet-DNA
     - Definitie, feiten, typen
3. Wat zijn de overeenkomsten tussen Repetitive DNA and Satellite DNA
     - Overzicht van gemeenschappelijke functies
4. Wat is het verschil tussen Repetitive DNA and Satellite DNA
     - Vergelijking van belangrijke verschillen

Sleutelbegrippen: herhaalde herhalingen, microsatellieten, minisatellieten, repetitief DNA, satelliet-DNA, tandem-herhalingen

Wat is Repetitive DNA

Repetitief DNA verwijst naar de stukken DNA die door het hele genoom heen worden herhaald. Het vertegenwoordigt een hoeveelheid van het niet-coderende DNA dat door het euchromatine is verspreid. De repetitieve eenheid kan bestaan ​​uit enkele baseparen tot honderden baseparen. De gemiddelde grootte van de repetitieve eenheid is 300 bp. Het kan 10-10 worden herhaald⁵ kopieën per genoom. De twee hoofdtypen repetitief DNA zijn tandemherhalingen en herhalende herhalingen. Tandemherhalingen worden getoond in Figuur 1.

Figuur 1: Tandem-herhalingen

In tandemherhalingen liggen de kopieën van een repetitieve reekseenheid naast elkaar, vormen een blok of een reeks. Satelliet-DNA is een type van tandemherhalingen. In herhaalde herhalingen worden de zich herhalende sequenties verspreid over het hele genoom als afzonderlijke eenheden geflankeerd door een unieke sequentie. De transponeerbare elementen zoals DNA-transposons en retrotransposons zijn afgewisselde herhalingen.

Wat is satelliet-DNA

Satelliet-DNA verwijst naar korte, repetitieve DNA-reeksen die vaak worden aangetroffen in centromere gebieden van het genoom. Het zijn de belangrijkste functionele eenheden van de centromeer. Satelliet-DNA wordt ook gevonden in het heterochromatine als een belangrijk structureel bestanddeel. In het menselijk genoom kan satelliet-DNA worden gevonden in chromosomen 1, 9 en 16 en de korte armen van chromosomen 13-15, 21 en 22. Satelliet-DNA is een soort tandemherhalingen. Het is samengesteld uit korte nucleotidesequenties rond 60 bp die meer dan 10 worden herhaald⁶ tijden in het genoom. De twee belangrijkste soorten satelliet-DNA zijn minisatellieten en microsatellieten. Een minisatellietsequentie wordt getoond in Figuur 2.

Figuur 2: Minisatelliet-DNA

Minisatellieten bestaan ​​uit 10-60 basenparen in de repeterende eenheid. Ze bevinden zich op veel plaatsen in het genoom, inclusief centromeren. Microsatellieten bestaan ​​uit minder dan 10 basenparen in de repeterende eenheid en ze worden voornamelijk aangetroffen in de telomeren.

Overeenkomsten tussen Repetitive DNA en Satellite DNA

• Repeterend DNA en satelliet-DNA zijn twee soorten DNA die worden gevonden in het eukaryotische genoom.
• Zowel repetitief DNA als satelliet-DNA bestaan ​​uit repeterende sequentie-eenheden.
• Zowel repetitief DNA als satelliet-DNA zijn typen niet-coderend DNA.
• Zowel repetitief DNA als satelliet-DNA coderen niet voor eiwitten.
• Zowel repetitief DNA als satelliet-DNA bevinden zich in intergene regio's.
• Zowel repetitief DNA als satelliet-DNA zijn belangrijk bij het handhaven van de structuur van het genoom.

Verschil tussen repetitief DNA en satelliet-DNA

Definitie

Repetitive DNA: Repetitief DNA verwijst naar de stukken DNA die door het hele genoom heen worden herhaald.

Satelliet DNA: Satelliet-DNA verwijst naar de korte zich herhalende DNA-sequenties die vaak worden aangetroffen in centromere gebieden van het genoom.

Typen herhalende sequenties

Repetitive DNA: Repetief DNA bestaat uit tandem-herhalingen of herhalende herhalingen.

Satelliet DNA: Satelliet-DNA bestaat uit tandem-herhalingen.

Grootte van de repetitieve eenheid

Repetitive DNA: Herhaald DNA kan bestaan ​​uit enkele basenparen tot honderden basenparen in de zich herhalende eenheid.

Satelliet DNA: Satelliet-DNA bestaat uit korte zich herhalende eenheden (tot 60 basenparen lang). 

Mate van herhaling

Repetitive DNA: Herhaald DNA is matig repetitieve sequenties (10-10⁵ herhalingen per genoom).

Satelliet DNA: Satelliet-DNA bestaat uit zeer repetitieve sequenties (> 10⁶ herhalingen per genoom).

Gevestigd in

Repetitive DNA: Herhaald DNA bevindt zich in de intergene gebieden van het genoom.

Satelliet DNA: Satelliet-DNA bevindt zich op specifieke chromosomen en centromeren van de chromosomen.

Types

Repetitive DNA: De twee hoofdtypen repetitief DNA zijn tandemherhalingen en herhalende herhalingen.

Satelliet DNA: De twee belangrijkste soorten satelliet-DNA zijn microsatellieten en minisatellieten.

Rol

Repetitive DNA: Herhaald DNA dient als een evolutionair apparaat en katalyseert de vorming van nieuwe genen.

Satelliet DNA: Satelliet-DNA speelt een belangrijke rol bij DNA-vingerafdrukken.

In CsCl Density Gradient-analyse

Repetitive DNA: Herhaald DNA verschijnt als lichte banden.

Satelliet DNA: Satelliet-DNA verschijnt als kleine donkere banden.

Conclusie

Repetitive DNA and Satellite DNA zijn twee soorten DNA-herhalingen die in het genoom worden aangetroffen. Herhaald DNA zijn matig-herhaalde DNA-sequenties terwijl satelliet-DNA zeer herhaalde, korte DNA-sequenties zijn. Het belangrijkste verschil tussen repetitief en satelliet-DNA is de mate van herhaling.

Referentie:

1.López-Flores, I., en M.A. Garrido-Ramos. "The Repetitive DNA Content of Eukaryotic Genomes." Karger Publishers, 25 juni 2012, hier beschikbaar.
2. Garrido-Ramos, Manuel A. "Satellite DNA: An Evolving Topic." Genes, MDPI, Sept. 2017, hier beschikbaar.

Afbeelding met dank aan:

1. "VNTR2individuals5or7repeats" By Madelyndotson - Eigen werk (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia