Verschil tussen CRISPR en Cas9
Share
De grootste verschil tussen CRISPR en Cas9 is dat CRISPR is een onderdeel van een bacterie verdediging systeem dat uit short bestaat palindroom sequenties terwijl Cas9 een endonuclease is die wordt geproduceerd door het CRISPR-systeem dat werkt als een moleculaire schaar. CRISPR staat voor Clustered Regular Interspaced Short Palindromic Repeats terwijl Cas staat voor CRISPR-associated protein 9. Het korte palindroom herhaalt de productie CRISPR RNA (crRNA) dat specifiek is voor de doelsequentie. Cas9 knipt de DNA-sequentie gespecificeerd door het crRNA.
CRISPR en Cas9 zijn twee componenten van het CRISPR / Cas9-systeem, een belangrijk onderdeel van het immuunsysteem van bacteriën, dat zich verdedigt tegen binnendringend virus. Op dit moment is het CRISPR / Cas9-systeem een van de snellere, goedkopere en nauwkeurigere genoombewerkingsgereedschappen met een breed scala aan toepassingen.
Key Areas Covered
1. Wat is CRISPR
- Definitie, structuur, genoombewerking
2. Wat is Cas9
- Definitie, feiten, Genome Editing
3. Wat zijn de overeenkomsten tussen CRISPR en Cas9
- Overzicht van gemeenschappelijke functies
4. Wat is het verschil tussen CRISPR en Cas9
- Vergelijking van belangrijke verschillen
Sleutelbegrippen
Cas9, CRISPR, CRISPR / Cas9, crRNA, Genome editing 
Wat is CRISPR
CRISPR (Clustered Regularly iknterspaced Short Palindromic Repeats) is een eenheid van de zich herhalende sequentie die wordt aangetroffen in bacteriële en archaeale genomen. Het werd voor het eerst ontdekt in archaea door Francisco Mojica. De zich herhalende sequenties van CRISPR worden onderbroken door spacersequenties. Deze spacersequenties zijn de overblijfselen van eerdere indringers. Daarom dient het systeem als het genetische geheugen voor het detecteren en vernietigen van de binnenvallende bacteriofaag. De spacersequenties worden getranscribeerd in korte RNA-sequenties die crRNA's worden genoemd, die het systeem leiden om te binden aan de specifieke doelsequenties. Eenmaal gebonden aan een dergelijke sequentie, snijdt een endonuclease gecodeerd door het CRISPR-systeem zoals Cas9 het gespecificeerde DNA door het uit te schakelen.
Figuur 1: CRISPR-systeem
CRISPER / Cas9 is een van nature voorkomend genoombewerkingsysteem in bacteriën. Het wordt ook gebruikt als hulpmiddel voor het bewerken van genonen in het laboratorium. Wetenschappers maken kunstmatig kleine RNA-moleculen genaamd gids RNA (gRNA) die binden aan een doelsequentie van een genoom. Zodra de doel-DNA-sequentie door de activiteit van Cas9 wordt afgeknipt, hersynthetiseren cellulaire mechanismen het DNA. Of anders kan het verwijderde deel van DNA worden vervangen door een ander DNA-stuk.
Wat is Cas9
Cas9 is een endonuclease dat specifiek dubbelstrengig DNA knipt. Het wordt gecodeerd door het bacteriële CRISPR-systeem. De doel-DNA-sequentie wordt gespecificeerd door het sycrRNA van het CRISPR-systeem. Door de doelwitsequentie te manipuleren, kan een CRISPR-systeem worden gebruikt om een bepaalde DNA-sequentie in een genoom te manipuleren. Daarom wordt het CRISPR / Cas9-systeem gebruikt om genetische aandoeningen te behandelen.
Figuur 2: Rol van Cas in het CRISPR-systeem
Een ander type endonucleasen dat met CRISPR-systemen kan werken, is Cpf1.
Overeenkomsten tussen CRISPR en Cas9
- CRISPR en Cas9 zijn twee componenten van het CRISPR / Cas9-systeem.
- Beide spelen een vitale rol in het adaptieve immuunsysteem van bacteriën door virale DNA uit het bacteriële genoom te identificeren en eruit te knippen.
- CRISPR / Cas9-systeem wordt gebruikt als hulpmiddel voor het bewerken van genoom.
Verschil tussen CRISPR en Cas9
Definitie
CRISPR verwijst naar een familie van DNA-sequenties gevonden in bacteriën en archaea terwijl Cas9 verwijst naar een RNA-geleide DNA-endonuclease geassocieerd met de CRISPR
Betekent
CRISPR staat geclusterd op regelmatige korte afstand palindromische herhalingen terwijl Cas staat voor CRISPR-geassocieerd eiwit.
Betekenis
CRISPR is een cluster van korte palindrome sequenties, terwijl Cas9 een endonuclease is, gecodeerd in de CRISPR.
Functie
CRISPR produceert crRNA dat specifiek aan een doelwitsequentie bindt, terwijl Cas9 als een moleculaire schaar dient die de door het crRNA gespecificeerde DNA-sequentie knipt..
Conclusie
CRISPR is een cluster van korte palindrome sequenties gevonden in het bacteriële genoom. Het is belangrijk bij het voorkomen van de binnenvallende bacteriofaag. Cas9 is een endonuclease gecodeerd door het CRISPR-systeem. Het snijdt de nucleotidesequentie af die wordt gespecificeerd door het crRNA. Het crRNA wordt geproduceerd door de transcriptie van de CRISPR-array. Het belangrijkste verschil tussen CRISPR en Cas9 is de functie van elke component in het CRISPR-systeem.
Referentie:
1. "Wat is CRISPR-Cas9?" feiten, Het Public Engagement Team op de Wellcome Genome Campus, 19 december 2016, hier beschikbaar
Afbeelding met dank aan:
1. "crRNA-Cas9" door marius walter - Eigen werk (CC BY-SA 4.0) via Wikimedia Commons
2. "Crispr" door James atmos - Eigen werk (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
