Verschil tussen 16s rRNA en 16s rDNA

Belangrijkste verschil - 16s rRNA versus 16s rDNA
 

Ribosomen zijn de biologische sites van eiwitsynthese in alle levende organismen. Ribosomen bevatten twee componenten; kleine subeenheid en een grote subeenheid. Prokaryote organismen en eukaryotische organismen verschillen van de samenstelling van ribosoom die ze bevatten. Elke subeenheid bestaat uit ribosomaal RNA en verschillende eiwitten. Deze twee subeenheden passen bij elkaar en werken als één tijdens de eiwitsynthese. Prokaryote ribosomen zijn de 70S en ze zijn samengesteld uit 30S kleine subeenheid en 50S grote subeenheid. Eukaryote ribosomen zijn 80S en ze zijn samengesteld uit 40S kleine subeenheid en 60S grote subeenheid. In prokaryoten is ribosomaal RNA van de kleine subeenheid van ribosomen bekend als 16s-rRNA. Dit 16s-rRNA wordt getranscribeerd van het chromosomale DNA dat bekend staat als 16s-rDNA. 16s rDNA is het gen dat 16s-rRNA door de transcriptie produceert. De belangrijk verschil tussen de 16s rRNA en 16s is rDNA dat 16s rRNA is het getranscribeerde enkelstrengige ribosomale RNA dat een component is van de kleine subeenheid van prokaryoten, terwijl 16s rDNA het dubbelstrengige chromosomale DNA is of het gen dat codeert voor 16s rRNA. Het gen van het 16s-rRNA is het 16s-rDNA.

INHOUD

1. Overzicht en belangrijkste verschil
2. Wat is 16s rRNA
3. Wat is 16's rDNA
4. Overeenkomsten Tussen 16s rRNA en 16s rDNA
5. Vergelijking zij aan zij - 16s rRNA versus 16s rDNA in tabelvorm
6. Samenvatting

Wat is 16s rRNA?

rRNA is een component van ribosomen. 16s-rRNA is de specifieke component van 30S kleine subeenheid van het prokaryote ribosoom dat bindt met Shine-Dalgarno-sequentie. Deze 16s-rRNA-sequentie vertoont een hoge variabiliteit tussen de bacteriesoorten. Daarom kan het worden gebruikt voor de bacteriële fylogenie en taxonomie.

Wat is 16's rDNA?

Prokaryoten hebben 70S-ribosomen. De kleine subeenheid van de prokaryote ribosomen is de 30S. Het ribosomale RNA (rRNA) van de 30S kleine subeenheid is bekend als 16s-rRNA en het gen 16s-rDNA codeert het. Vandaar dat 16s rDNA bekend staat als 16s rRNA-gen. 16s rDNA is chromosomaal DNA. Het is dubbelstrengs en het is een gen dat bestaat uit coderende en niet-coderende regio's. Wanneer het 16s-rDNA-gen wordt getranscribeerd, produceert het 16s-rRNA-sequentie. 16s rDNA is universele DNA-sequentie in prokaryoten. De sequentie van het 16s-rDNA onder de prokaryoten varieert echter. Het vergemakkelijkt het gebruik van 16s rDNA-sequenties in nauwkeurige identificatie van bacteriesoorten en ook voor de ontdekking van nieuwe bacteriesoorten.

16s rDNA speelt een belangrijke rol in bacteriële fylogenie en taxonomie. Daarom wordt het gebruikt als een betrouwbare moleculaire marker in fylogenetische studies van prokaryoten, omdat het in hoge mate geconserveerd is tussen verschillende soorten. 16s rDNA-nucleotidesequentie heeft negen hypervariabele regio's (V1-V9) die een goede bron bieden voor differentiatie van bacteriën en archaea.

Figuur 01: DNA en RNA

De sequentiebepaling van 16s rDNA-gen heeft herclassificatie van de bacteriën in nieuwe soorten of geslachten vergemakkelijkt. Vandaar dat dit gen wordt gebruikt in moleculaire laboratoria als een meest voorkomende huishoudelijke marker voor de identificatie van microben. Er zijn verschillende redenen die 16srDNA als de beste marker voor identificatie van microben maakten, zoals de aanwezigheid van 16srDNA in alle bacteriën, de onveranderde aard van de functie van het 16s-rDNA-gen in de loop van de tijd, en de grote omvang van 16s-rDNA dat het maakt genoeg voor informatiedoeleinden.

Wat zijn de overeenkomsten tussen 16s rRNA en 16s rDNA?

• Beide zijn nucleïnezuren.
• Beide zijn opgebouwd uit nucleotiden.
• Beide zijn gerelateerd aan ribosomaal RNA.

Wat is het verschil tussen 16s rRNA en 16s rDNA?

16s rRNA versus 16s rDNA
16s-rRNA is de ribosomale RNA-component van de kleine subeenheid van 30s ribosoom van prokaryoten.	16s rDNA is het chromosomale DNA dat codeert voor de 16s-rRNA-sequentie van prokaryoten.
Aantal strengen
16s rRNA is enkelstrengs.	16s rDNA is dubbelstrengs
Gen of volgorde
16s rRNA is een getranscribeerd RNA van een gen.	16s rDNA is een gen.
Coderingsvolgorde
16s-rRNA heeft alleen de coderende sequentie.	16s rDNA heeft zowel coderende als niet-coderende strengen.
Uracil-basis
16s-rRNA bevat Uracil-basen in zijn nucleotidesequentie.	16s-rDNA bevat geen base Uracil in zijn nucleotidensequenties.
Thymin Base
16s-rRNA bevat geen Thymine-basen in zijn nucleotidesequentie.	16s-rDNA bevat Thymine-basen in zijn nucleotidesequenties.
Synthese
16s rRNA wordt gemaakt na transcriptie van 16s rDNA-gen.	16s rDNA bevindt zich in het genoom van de prokaryoten.

Samenvatting - 16s rRNA versus 16s rDNA 

16s-rRNA is de ribosomale RNA-component van de kleine subeenheid van ribosomen van prokaryoten. Het gen 16s-rDNA codeert voor deze RNA-sequentie. 16s-rRNA is enkelstrengs en 16s-rDNA is dubbelstrengs. Dit is het verschil tussen 16s rRNA en 16s rDNA.

Download het rRNA van de PDF 16s rRNA vs 16s

U kunt de PDF-versie van dit artikel downloaden en gebruiken voor offline doeleinden, zoals per citaatnotitie. Download hier de pdf-versie Difference Between 16s rRNA and 16s rDNA

Referentie:

1.Janda, J. Michael en Sharon L. Abbott. "16S rRNA-gensequentiebepaling voor bacteriële identificatie in het diagnostisch laboratorium: pluspunten, gevaren en valkuilen." Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, september 2007. Beschikbaar Hier  
2. "Ribosome." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 13 januari 2018. Beschikbaar Hier  
3.Woo, P C, et al. "Toen en nu: gebruik van 16S rDNA-gensequencing voor bacteriële identificatie en ontdekking van nieuwe bacteriën in laboratoria voor klinische microbiologie." Klinische microbiologie en infectie: de officiële publicatie van de European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases., US National Library of Medicine , Oktober 2008. Beschikbaar Hier 

Afbeelding met dank aan:

1. 'Difference DNA RNA-EN' By Sponk (talk) - Chemische structuren van nucleobasen door Roland1952, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia