Verschil tussen Transposon en Retrotransposon

Transposon versus Retrotransposon

Transposons en retrotransposons zijn genetische componenten van DNA en er zijn grote verschillen tussen hen. Het percentage van de aanwezigheid van deze genetische materialen varieert per soort, en hun functies bepalen het lot van het organisme met mutaties en andere fenotypisch belangrijke veranderingen. Transposons en retrotransposons zijn genen of collecties van bepaalde genen die zich in de DNA-strengen bevinden en wijzigingen in hun locaties zijn de belangrijkste oorzaken van deze gevolgen. Dit artikel is echter bedoeld om de functies van deze genen kort te bespreken en presenteert een vergelijking tussen transposons en retrotransposons.

Wat is Transposon?

Transposons zijn interessante fragmenten of segmenten van DNA met het vermogen om de locatie van de DNA-streng te veranderen in de vorm van een knip-en-plakmechanisme. Vanwege deze mobiele aard van de transposons zijn deze bekend als springgenen. Transposons zijn van twee hoofdtypen die bekend staan ​​als Klasse I Transposons en Klasse II Transposons. Gewoonlijk wordt het Klasse II-type aangeduid als de transposons en wordt het Klasse I-type aangeduid als de retrotransposons. De processen van knippen en plakken van mobiele DNA-segmenten worden gereguleerd door het enzymtransposase. Het enzym bindt aan de beide uiteinden van het transposon en knipt de fosfodiesterbindingen van de DNA-streng, isoleert het transposon, verplaatst het naar de doelwitplaats en bindt op de nieuwe locatie. Dit proces is echter interessant om te begrijpen, omdat sommige transposons alleen naar bepaalde locaties kunnen verplaatsen vanwege de incompatibiliteit van basensequenties met de doelsite. Genen met één uiteinde van een enkele streng hebben dezelfde basensequentie met het andere uiteinde van de andere enkele streng transposons met plakkerige randen, omdat die kunnen binden aan de plaatsen van de doel-DNA-streng met dezelfde basensequentie als in de kleverige uiteinden . Deze mobiliteit van genen kan echter zowel veranderingen van het genotype als van het fenotype van het organisme veroorzaken. Wetenschappers uitgevonden over de transposons en genetisch gemodificeerd voedsel en organismen volgens de gewenste aanpassingen werden vervolgens beschikbaar gemaakt. Zeer productieve landbouwgewassen, antibiotica met medicinale eigenschappen, vee waren enkele van de gunstig ontwikkelde producten na de uitvinding van transposons door Barbara McClintock in de jaren 40.

Wat is Retrotransposon?

Retrotransposons zijn de klasse I-transposons en deze bewegen zich door het genoom via het mechanisme van kopiëren en plakken. Het mechanisme van de mobiliteit van retrotransposons omvat weinig belangrijke stappen, zoals het kopiëren van het gensegment van de DNA-streng in RNA, overdracht van de kopie van RNA naar de doelwitplaats, transcriptie van de RNA-sequentie terug naar DNA met behulp van reverse transcriptase en insertie. van het gen naar de nieuwe locatie van de DNA-streng van het genoom. De twee uiteinden van deze retrotransposons hebben gewoonlijk lange terminale herhalingen met ongeveer 1000 basenparen en die worden gebruikt als identificerende kenmerken van deze genen. Deze genen worden gemakkelijk geamplificeerd binnen het genoom en het percentage retrotransposons in het menselijk genoom is ongeveer 50%. Deze kunnen behoorlijk gevaarlijk zijn omdat het oorzakelijke virus van AIDS-, HIV- en T-celleukemievirus de retrotransposons in hun RNA-genomen hebben. In feite kunnen deze virussen de retrotransposons binden aan elke plaats van de menselijke DNA-strengen met het gebruik van reverse transcriptase en integrase. Het integrase-enzym functioneert op dezelfde manier als transposase in Klasse II-transposons.