Verschil tussen rooted en unrooted Phylogenetic Tree

Belangrijk verschil - Geworteld versus onbewortelde fylogenetische boom
 

Fylogenie is een belangrijk veld dat het leven op aarde door de tijd heen onderzoekt. Het onthult het verband tussen organismen met hun voorouders en afstammelingen. De relaties tussen organismen worden schematisch weergegeven door verschillende boomachtige voorstellingen, zoals dendogram, cladogram, fenogram, phylogram, enz. Een fylogenetische boom is een vertakkend boomachtig diagram dat de fylogenetische relaties tussen organismen verklaart met de hoeveelheid evolutionaire afstand. Er zijn twee hoofdtypen fylogenetische bomen die bekend staan ​​als geroot en niet-geworteld. Het belangrijkste verschil tussen de geroote en onbewortelde fylogenetische boom is dat geroote boom toont de meest basale voorouder van de boom terwijl onbewortelde fylogenetische boom toont geen voorouderlijke wortel.

INHOUD
1. Overzicht en belangrijkste verschil
2. Wat is een Phylogenetic Tree met wortels
3. Wat is een Unrooted Phylogenetic Tree
4. Vergelijking zij aan zij - Geworteld versus onbewortelde fylogenetische boom
5. Samenvatting

Wat is een Phylogenetic Tree met wortels?

Een gefokte fylogenetische boom dient als een nuttig diagram dat de evolutionaire geschiedenis laat zien. Het heeft een basaal knooppunt dat de wortel wordt genoemd, wat de gemeenschappelijke voorouder van alle groepen van de boom weergeeft. De wortel van een boom wordt beschouwd als het oudste punt in de boom dat de laatste gemeenschappelijke voorouder is van alle groepen in de boom. Vandaar dat een geroote boom de richting van de evolutionaire tijd aangeeft. Van een enkele soort van een gerootte boom kan de gemeenschappelijke voorouders of de soortouder worden gevonden door terug te traceren naar de basale knoop. Omdat de geroote boom de richting van de evolutionaire tijd weergeeft, is het gemakkelijk om de oudere of nieuwere groepen te vinden. Een geroote boom kan worden gebruikt om de volledige groepen organismen te bestuderen. Nauwkeurig rooten van een fylogenetische boom is een belangrijke en cruciale factor, omdat onnauwkeurig bewortelen kan resulteren in verkeerde interpretaties van genetische veranderingen tussen organismen en hun richting van de evolutie..

Figuur 01: Een geroote fylogenetische boom

Wat is een Unrooted Phylogenetic Tree?

Een niet-wortelgestuurde fylogenetische boom is een fylogenetisch diagram dat een gemeenschappelijke voorouder of een basale knoop mist. Dit type boom geeft niet de oorsprong van de evolutie van de belangengroepen aan. Het geeft alleen de relatie weer tussen organismen, ongeacht de richting van de evolutionaire tijdlijn. Daarom is het moeilijk om de evolutionaire relaties van de groepen met betrekking tot tijd te bestuderen met behulp van een onbewortelde boom.

Er zijn twee manieren om een ​​onbewortelde fylogenetische boom te rooten. Zij zijn

• Een outgroup zoeken - Dit vereist voorkennis over de relaties tussen taxa. Dan kan een taxon dat buiten de groep ligt als een outgroup worden gebruikt om een ​​geroote fylogenetische boom te tekenen

• Het middelpunt of de afstand vinden - Het middelpunt van de meest verre twee taxa in de boom kan worden verondersteld als een wortel voor de fylogenetische boom.

Figuur 02: Een onbewortelde fylogenetische boom

Wat is het verschil tussen Wortel en Ongewortelde Phylogenetische Boom?

Geworteld tegen onbewortelde fylogenetische boom
Een geroote fylogenetische boom is een diagram dat de laatste gemeenschappelijke voorouder van de groepen toont.	Een onbewortelde fylogenetische boom toont de relaties tussen organismen zonder de gemeenschappelijke voorouder te laten zien.
Knooppunt
Het heeft een knooppunt (root).	Het heeft geen knooppunt.
Direction of Evolution
Het heeft een richting om de evolutionaire tijd aan te geven.	Het specificeert geen evolutionaire relatie.
Houding tegenover anderen
De boom maakt het mogelijk om de voorouder - afstammingsrelatie tussen groepen te bepalen.	De boom staat niet toe te praten over de relatie tussen voorouders en afstammelingen.

Samenvatting - Geworteld versus onbewortelde fylogenetische boom

Een fylogenetische boom vertegenwoordigt de evolutionaire paden en verbindingen tussen organismen met behulp van vertakte boomachtige diagrammen. Fylogenetische bomen kunnen worden geroot of worden weggeworteld. Een geroote boom heeft een knooppunt aan de basis, die de gemeenschappelijke voorouder vertegenwoordigt die alle belangengroepen met elkaar verbindt. Een ongetrainde boom toont de relaties tussen organismen. Het geeft echter niet de gemeenschappelijke voorouder weer die alle groepen delen. Dit is het verschil tussen de geroote en niet-gewortelde fylogenetische boom.

Referenties:
1. "Boom" -feiten: geschoten of onbewortelde bomen. "Nationaal centrum voor biotechnologische informatie. Amerikaanse National Library of Medicine, n.d. Web. 4 april 2017
2. Graham, Sean W., Richard G. Olmstead en Spencer C.H. Barrett. "Roeien van fylogenetische bomen met verre outgroups: een case study van de Commelinoid Monocots." Molecular Biology and Evolution. Oxford University Press, 01 oktober 2002. Web. 4 april 2017