Agarose en polyacrylamide zijn beide in water oplosbare polymeren, maar ertussen verschillen veel, te beginnen vanaf hun oorsprong. Zowel Agarose als Polyacrylamide hebben iets gemeenschappelijks in hun vermogen om poreuze gelmatrices te vormen. Desondanks zijn er een aantal duidelijke verschillen tussen beide. De belangrijkste verschillen tussen deze beide polymeren liggen in hun aard van oorsprong, chemische structuur, hun verschillende toepassingen en hun prestaties in termen van gelelektroforese..
Agarose is een natuurlijk voorkomend lineair polymeer dat op zijn beurt is afgeleid van een complex polymeer genaamd agar dat wordt aangetroffen in zeewier. Agarose wordt geëxtraheerd uit agar door de verwijdering van zijn eiwitcomponent genaamd agaropectine. Agarose geeft agar zijn vermogen om gels te vormen.
Het belangrijkste gebruik van agarose is in microbiologische en moleculair biologische studies. In microbiologische studies biedt agarose, wanneer aangevuld met geschikte voedingsstoffen, een solide basis voor het kweken van micro-organismen zoals bacteriën en schimmels. Bij gebruik in halfvaste concentraties kan het nuttig zijn bij het beoordelen van de beweeglijkheid van deze micro-organismen. In de moleculaire biologie dient het als een belangrijk hulpmiddel voor een van de meest fundamentele oplossingsprocessen genaamd 'gelelektroforese'of'agarosegelelektroforese'(LEEFTIJD). Gelelektroforese is een proces dat de resolutie of scheiding van nucleïnezuren of eiwit mogelijk maakt op basis van hun grootte en lading. Hier dient agarose als een poreuze zeefachtige gel waardoor afscheiding optreedt.
Agarose structuur
Polyacrylamide is een synthetisch polymeer en wordt gebruikt in een breed scala van industrieën. Zoals eerder vermeld, is het gebruik ervan afhankelijk van het vermogen om gels te vormen. In aanvulling hierop wordt het vermogen om water in verschillende concentraties vast te houden en af te voeren ook gebruikt in verschillende industrieën.
De meest voorkomende en Veelgebruikt polyacrylamide is de behandeling van afvalwater. Hier wordt het gebruikt als een flocculatiemiddel om gesuspendeerd organisch materiaal te verwijderen; vandaar, het verbeteren van troebelheid en het verduidelijken van het water. Een ander gebruik van polyacrylamide is in de papierindustrie. Hier wordt het gebruikt voor het vasthouden of afvoeren van water uit de papierpulp zoals vereist. Evenzo wordt het in de landbouw- en constructie-industrie gebruikt als bodemverbeteraar om bodemerosie te voorkomen en de kwaliteit ervan te verbeteren.
Net als agarose wordt polyacrylamide ook gebruikt in de moleculaire biologie als een belangrijk oplossingsinstrument in een vergelijkbaar proces dat 'Polyacrylamide gelelektroforese '(PAGE). Naast dit alles wordt Polyacrylamide ook gebruikt in de ertsverwerking en productie van flocculatiemiddel om eventueel gesuspendeerd organisch materiaal te verwijderen; vandaar, het verbeteren van troebelheid en het verduidelijken van het water. Een ander gebruik van polyacrylamide is in de papierindustrie. Hier wordt het gebruikt voor het vasthouden of afvoeren van water uit de papierpulp zoals vereist. Evenzo wordt het in de landbouw- en constructie-industrie gebruikt als bodemverbeteraar om bodemerosie te voorkomen en de kwaliteit ervan te verbeteren. Naast dit alles, Polyacrylamide wordt ook gebruikt in de productie van levensmiddelenadditieven, zachte contactlenzen en textiel.
Polyacrylamidestructuur
agarose: Agarose is een polymeer van natuurlijke oorsprong. Het is afgeleid van zeewier.
polyacrylamide: Polyacrylamide is van synthetische oorsprong en wordt onder geen enkele omstandigheid gevonden.
agarose: De moleculaire formule van agarose is C24H38O19.
polyacrylamide: De molecuulformule van polyacrylamide is (C. 3H5NEE)n.
agarose: Agarose is een lineair polysaccharide. Het bestaat uit herhalende disaccharide-eenheden, agrobiose genaamd, die door waterstofbruggen bij elkaar worden gehouden.
polyacrylamide: Polyacrylamide is een chemisch verknoopt polymeer. Het bestaat uit acrylamidemonomeren en een verknopingsmiddel N, N'-methyleenbisacrylamide.
agarose: Zowel agarose als agrobiose van de monomeereenheid zijn niet-toxisch van aard.
polyacrylamide: De monomeereenheid van polyacrylamide, het acrylamide, is een verondersteld carcinogeen en bekend neurotoxine, terwijl de gepolymeriseerde vorm niet-toxisch van aard is.
agarose: Agarose-gelpreparaat voor AGE is minder tijdrovend, gemakkelijk en eenvoudig, en vereist geen initiator of polymerisatiekatalysator.
polyacrylamide: Polyacrylamidegelpreparaat voor PAGE is tijdrovend en vervelend en vereist ook een initiator (ammoniumpersulfaat) en polymerisatiekatalysator (N, N, N ', N'-tetramethylethyleendiamine - TEMED).
Polyacrylamidegels zijn chemisch stabieler dan agarosegelen.
Gegeven dezelfde concentratie hebben polyacrylamide gelmatrices de neiging kleinere poriëngroottes te hebben in vergelijking met die van een agarose gelmatrix.
De poriegrootte van polyacrylamidegels kan op een meer gereguleerde wijze worden veranderd dan die van agarosegelen.
Polyacrylamidegels hebben een hoog oplossend vermogen, terwijl agarosegelen een laag oplossend vermogen hebben.
Polyacrylamidegelen kunnen grotere hoeveelheden nucleïnezuur dan agarosegels voor resolutie-eenheden bevatten.
Afbeeldingen beleefdheid: agarose en Structuur van polyacrylamide via Wikicommons (Public Domain)