Verschil tussen stapelgel en scheidingsgel

Belangrijkste verschil - Stapelen van gel vs scheiden Gel
 

De termen stapelende gel en scheidende gel worden gebruikt bij het verklaren van de SDS-PAGE-techniek. SDS-PAGE of natriumdodecylsulfaat-polyacrylamidegelelektroforese is een laboratoriumtechniek die wordt gebruikt om eiwitmoleculen te scheiden op basis van hun molecuulgewichten. De theorie achter de techniek is dat eiwitten met verschillende molecuulgewichten verschillende migratiesnelheden vertonen; moleculen met een laag moleculair gewicht migreren sneller terwijl moleculen met een hoog molecuulgewicht langzaam migreren. Het medium voor migratie is een gel. Er zijn twee soorten gels genaamd stacking gel en separating gel. De belangrijk verschil tussen stapelgel en scheidende gel is dat de pH van de stapelgel is 6,8, terwijl de pH van de scheidingsgel 8,8 is.

INHOUD

1. Overzicht en belangrijkste verschil
2. Wat is Stacking Gel
3. Wat is scheidende gel
4. Relatie tussen stapelende gel en scheidende gel
5. Vergelijking zij aan zij - Stapelbare gel versus scheidende gel in tabelvorm
6. Samenvatting

Wat is Stacking Gel?

Stapellaag is een laag geconcentreerde polyacrylamidegel die op de bovenkant van meer geconcentreerde scheidende gel (scheidingsgel) wordt geplaatst in de SDS-PAGE-techniek. De stapelgel wordt gebruikt om de resolutie van elektroforese te verbeteren. De resolutie neemt toe vanwege het verschil tussen concentraties van stapelgel en scheidende gel die effect hebben op de eiwitten in het monster. Omdat de concentratie polyacrylamide in stapelgel laag is, is de poriegrootte groter. Dit helpt ook bij het vergroten van de scheiding.

De stapelgel is een losse polyacrylamidegel met grote poriën van ongeveer 7% polyacrylamide. Deze poriën werken niet als een aanzienlijke barrière voor grote eiwitmoleculen. Vandaar dat deze gel een weinig invloed heeft op de mobiliteit van die eiwitten. Dit maakt scheiding volgens de mobiliteit en grootte van eiwit door ze te concentreren tussen twee gels.

Afbeelding 01: SDS-PAGE Acrylamide-gel

De pH van de stapelgel is 6,8. De pH is zure dan die van het oplossen van gel door 2 pH-eenheden. Deze pH impliceert een lagere ionsterkte, vandaar een hogere elektrische weerstand. Dit veroorzaakt de mobiliteit van eiwitten dan andere geladen deeltjes die in de gel aanwezig zijn.

Wat is scheidende gel?

Scheidende gel of scheidende gel van een SDS-PAGEtechniek is een hooggeconcentreerde polyacrylamidegel die op de bovenkant van laaggeconcentreerde stapelgel wordt geplaatst. De scheidende gel bevat een grote hoeveelheid polyacrylamide (10%). De pH van deze gel wordt gehandhaafd als pH = 8,8, wat een hoger pH-niveau is dan dat van de stapelgel.

Figuur 02: Een gelelektroforese-apparaat

Wanneer de eiwitmoleculen de scheidingsgel bereiken, wordt de migratie van die moleculen vertraagd omdat de scheidingsgel een gel met hoge concentratie is met een kleine poriegrootte die kan werken als een aanzienlijke barrière voor de beweging van de eiwitmoleculen. Door deze vertraging kunnen de andere eiwitten langzaam migreren om bij te komen, wat resulteert in een smalle, geconcentreerde band tussen de twee gels.

Wat is de relatie tussen stapelende gel en scheidende gel?

• Zowel de Stacking Gel als de Separating Gel worden in hetzelfde apparaat gebruikt.

Wat is het verschil tussen stapelgel en scheidingsgel?

Gel en scheidende gel stapelen
Stapellaag is een laag geconcentreerde polyacrylamidegel die wordt geplaatst op de bovenkant van meer geconcentreerde scheidende gel (scheidingsgel) in SDS-PAGE-techniek.	Scheidende gel of scheidende gel met een SDS-PAGE-techniek is een sterk geconcentreerde polyacrylamidegel die op de bovenkant van een laaggeconcentreerde stapelgel wordt geplaatst.
Plaatsing
Stapelgel wordt op de scheidende (scheidende) gel geplaatst.	Scheidende gel wordt op de bodem van de container geplaatst die voor gelelektroforese wordt gebruikt.
Concentratie
De concentratie van stapelgel is hoog.	De concentratie van scheidende gel is laag.
Polyacrylamide-inhoud
Stapelgel bevat ongeveer 7% polyacrylamide.	Scheidende gel bevat ongeveer 10% polyacrylamide.
pH
De pH van de stapelgel is 6,8.	De pH van de scheidende gel is 8,8.
Porie grootte
Grote poriegroottes zijn aanwezig in stapelgel.	Kleine poriegroottes zijn aanwezig in scheidende gel.
Resolutie
Stapelgel geeft een betere resolutie.	Het scheiden van gel geeft een slechte resolutie.

Samenvatting - Gel stapelen en scheiden Gel

Stapelgel en scheidende gel zijn twee soorten polyacrylamidegels die worden gebruikt om een ​​betere scheiding van eiwitmoleculen in een bepaald monster te verkrijgen. Het verschil tussen stapelgel en scheidingsgel is dat de pH van de stapelgel 6,8 is, terwijl de pH van de scheidingsgel 8,8 is..

Referentie:

1. "Polyacrylamide gelelektroforese." Polyacrylamide gelelektroforese (theorie): moleculaire biologie Virtual Lab II: biotechnologie en biomedische technologie: Amrita Vishwa Vidyapeetham Virtual Lab. Beschikbaar Hier  
2. "Hoe SDS-PAGE werkt." Bitesize Bio, 16 februari 2018. Beschikbaar Hier
3. "SDS-PAGE stapelgel - BICH 608 (Polymenis-Pettigrew)." Google-sites. Beschikbaar Hier 

Afbeelding met dank aan:

1.'SDS-PAGE Acrylamide gel'door Bensaccount op Engelse Wikipedia, (CC BY 3.0) via Commons Wikimedia  
2. 'Gelelektroforese apparaat' door Jeffrey M. Vinocur - Eigen werk,  (CC-BY 2.5) via Commons Wikimedia