Verschil tussen Ti en Ri-plasmide

Belangrijkste verschil - Ti vs Ri Plasmid

Agrobacterium soorten zijn plantpathogenen die bij hogere planten verschillende ziekten veroorzaken. Ti (tumor-inducerende) en Ri (wortel-inducerende) plasmiden zijn twee soorten natuurlijke plasmiden geproduceerd door Agrobacterium soorten. Ti-plasmiden worden geproduceerd door Agrobacterium tumefaciens terwijl Ri-plasmiden worden geproduceerd door Agrobacterium rhizogenes. Zowel Ti- als Ri-plasmiden bestaan ​​uit een deel van het plasmide-DNA dat bekend staat als T-DNA en dat wordt overgebracht naar het plantengenoom met behulp van virulentie (vir) genen. De grootste verschil tussen Ti en Ri plasmide is dat Ti-plasmide induceert tumor / kroongal in dicotylen terwijl Ri-plasmide harige wortels induceert. Vanwege hun vermogen om planten te infecteren, worden zowel Ti- als Ri-plasmiden veel gebruikt als vectoren om transgene planten te produceren.

Key Areas Covered

1. Wat is Ti Plasmid
     - Definitie, structuur, vectorproductie
2. Wat is Ri Plasmid
     - Definitie, structuur, vectorvorming
3. Wat zijn de overeenkomsten tussen Ti en Ri-plasmide
     - Overzicht van gemeenschappelijke functies
4. Wat is het verschil tussen Ti en Ri-plasmide
    - Vergelijking van belangrijke verschillen

Belangrijkste begrippen: Agrobacterium Species, Genetic Engineering, Hairy Roots, Ri Plasmid (PRI), T-DNA, Ti-plasmide (pTi), Tumor, vir Genes

Wat is Ti Plasmid

Ti-plasmide verwijst naar een type plasmide van dat toelaat Agrobacterium tumefaciens om planten te infecteren, het produceren van een tumor tumor / kroon gal tumor. Aldus bestaat het Ti-plasmide uit zowel tumorvorming als virulentie (vir) genen. De vir genen zijn verantwoordelijk voor de overdracht van T-DNA dat de tumorvormende genen in het plantengenoom bevat door excisie en integratie. Een typerend Ti-plasmide bestaat uit vier gebieden: regio A (T-DNA verantwoordelijk voor tumorvorming), regio B (verantwoordelijk voor replicatie), regio C (verantwoordelijk voor conjugatie) en regio D (verantwoordelijk voor virulentie). De genen in het T-DNA-gebied controleren de productie van plantengroeihormonen (auxine en agropine), waardoor de proliferatie van de geïnfecteerde plantencellen wordt geïnduceerd. Beide uiteinden van het T-DNA-gebied worden geflankeerd door een grenssequentie die herhalingen van de directe sequentie van 24 basenparen bevat. Alleen de juiste grens is onmisbaar voor overdracht van T-DNA. De structuur van Ti-plasmide is weergegeven in Figuur 1.

Figuur 1: Ti-plasmide

In de Agrobacterium-gemedieerde transformatie van genen, de vector is ontworpen op basis van het Ti-plasmide. De vector is samengesteld uit grenssequenties van T-DNA, de vir genen en het gemodificeerde T-DNA-gebied. Tijdens de modificatie van het T-DNA-gebied worden de genen die verantwoordelijk zijn voor de tumorvorming verwijderd en vervangen door de vreemde genen die getransformeerd moeten worden. 

Wat is Ri Plasmid

Ri-plasmide verwijst naar een type plasmide dat dit toestaat Agrobacterium rhizogenes om pant-cellen te infecteren door harige wortels te produceren. Het bestaat uit twee T-DNA-fragmenten bekend als Tr-DNA en T1-DNA. Beide fragmenten worden gescheiden door een DNA-segment van 15 kb. Het Tr-DNA is vergelijkbaar met het T-DNA-gebied van het Ti-plasmide en bevat genen die de productie van groeihormonen induceren. Het T1-DNA-gebied bestaat uit vier genen: rolA (verantwoordelijk voor de vorming van harige wortels), rolB (induceert wortelinitiatie en callusvorming), rolC (bevordert de wortelgroei), en rolD- (onderdrukt de groei van callus). De transformatie van T-DNA wordt veroorzaakt door de vir genen. De vorming van harige wortels door Agrobacterium rhizogenes wordt getoond in Figuur 2.

Figuur 2: Harige wortels

Ti-plasmiden worden meestal vervangen door Ri-plasmiden in genetische manipulatie.

Overeenkomsten tussen Ti en Ri Plasmid

• Ti en Ri plasmiden worden van nature geproduceerd door Agrobacterium.
• Beide typen plasmiden veroorzaken ziekten in veel tweezaadlobbige planten.
• Zowel Ti als Ri plasmiden overbrengen een deel van het plasmide-DNA bekend als T-DNA in het plantengenoom met behulp van virulentie (vir) genen.
• De grootte van zowel Ti- als Ri-plasmiden is ongeveer 200 kb.
• De regulerende sequenties van sommige genen die worden gevonden in het T-DNA van beide plasmiden worden herkend door de cellulaire mechanismen van de plant.
• De andere genen in het T-DNA bestaan ​​uit prokaryote regulerende sequenties.
• Vanwege het vermogen om plantencellen te infecteren, worden zowel Ti- als Ri-plasmiden gebruikt bij genetische manipulatie om transgene planten te produceren.

Verschil tussen Ti en Ri-plasmide

Definitie

Ti Plasmid: Ti-plasmide is een type plasmide van dat het de bacteriën mogelijk maakt om planten te infecteren, waarbij een tumor / kroon-gal-tumor wordt geproduceerd.

Ri Plasmid: Ri-plasmide is een type plasmide waarmee bacteriën plantencellen kunnen infecteren door harige wortels te produceren.

Soort van Agrobacterium soorten

Ti Plasmid: Ti-plasmide wordt geproduceerd door Agrobacterium tumefaciens.

Ri Plasmid: Ri-plasmide wordt geproduceerd door Agrobacterium rhizogenes.

Grootte

Ti Plasmid: De grootte van het Ti-plasmide is 180-205 kb.

Ri Plasmid: De grootte van het Ri-plasmide is 250 kb.

Type ziekte

Ti Plasmid: Ti-plasmide induceert de vorming van kroongal / tumor.

Ri Plasmid: Ri-plasmide induceert de vorming van harige wortels.

Soort studie

Ti Plasmid: Ti-plasmiden zijn minder bestudeerd in vergelijking met Ri-plasmiden.

Ri Plasmid: Ri-plasmiden zijn goed bestudeerd.

Conclusie

Ti-plasmide en Ri-plasmide zijn twee soorten plasmiden die in verschillende worden aangetroffen Agrobacterium soorten. Zowel Ti-plasmiden als Ri-plasmiden bestaan ​​uit T-DNA en vir genen. Ti-plasmiden zijn te vinden in Agrobacterium tumefaciens die de vorming van kroongal tumor induceert. Ri-plasmiden zijn te vinden in Agrobacterium rhizogenes die de vorming van harige wortels induceert. Het belangrijkste verschil tussen Ti en Ri-plasmide is het type ziekte veroorzaakt door elk type plasmide.

Referentie:

1. "Lezing 26: Ti en Ri-plasmiden." NPTEL, IIT Guwahati, hier beschikbaar.
2.Haneef, Deena T Kochunni Jazir. "Agrobacterium rhizhogenes en Ri Plasmid." Hier beschikbaar.

Afbeelding met dank aan:

 1. "Ti plasmid" By Mouagip - Eigen werk (CC0) via Commons Wikimedia
2. "Agrobacterium rhizogenes" door FruitDefendu - Eigen werk (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia