Verschil tussen snRNA en snoRNA

Belangrijkste verschil - snRNA versus snoRNA

snRNA en snoRNA zijn twee soorten kleine, niet-coderende RNA-moleculen die in de cel worden gevonden. Zowel snRNA als snoRNA zijn betrokken bij het modificeren van RNA net na de transcriptie. Het snRNA wordt gevonden in splicing spikkels en Cajal lichamen van de kern van de cel. De gefosforyleerde adapter voor nucleaire export (PHAX) is betrokken bij het transport van snRNA en snoRNA naar de plaats van actie in de kern. De grootste verschil tussen snRNA en snoRNA is dat snRNA is betrokken bij de alternatieve splitsing van pre-mRNA-moleculen om te bepalen welke sequentie naar een eiwit moet worden getranslateerd, terwijl snoRNA is betrokken bij het modificeren van rRNA en tRNA, mRNA-bewerking en genoomimprimering.

Key Areas Covered

1. Wat is snRNA
      - Definitie, functies, functie
2. Wat is SnoRNA
      - Definitie, functies, functie
3. Wat zijn de overeenkomsten tussen snRNA en snoRNA
      - Overzicht van gemeenschappelijke functies
4. Wat is het verschil tussen snRNA en snoRNA
      - Vergelijking van belangrijke verschillen

Sleutelbegrippen: alternatieve splicing, genoomafdrukken, modificeren van rRNA, mRNA-bewerking, klein nucleair RNA (snRNA), klein nucleolair RNA (snoRNA), U-RNA

Wat is snRNA

Klein nucleair RNA (SnRNA) is een type klein niet-coderend RNA, dat bestaat uit 80 tot 350 nucleotiden in de moleculen. De snRNA wordt ook wel genoemd U-RNA en ze kunnen gevonden worden in splicing spikkels en Cajal lichamen van de kern. Het snRNA is een bestanddeel van de kleine nucleaire ribonucleoproteïnen (snRNP's), dat het spliceosoom vormt dat de splitsing van pre-mRNA-moleculen reguleert tijdens de post-transcriptionele modificaties. Eukaryoot pre-mRNA bestaat uit zowel introns als exons. De introns moeten uit de sequentie worden verwijderd door exonen aan elkaar te lijmen.

Figuur 1: RNA-splitsing

De alternatieve splitsing in eukaryoten produceert verschillende sequenties van mRNA, waarbij verschillende soorten eiwitten worden gevormd. Een spliceosoom bevat ongeveer 145 eiwitten. Deze eiwitten spelen een rol bij genexpressie in plaats van bij splicing. De vijf typen snRNP's zijn betrokken bij het splitsen van U1, U2, U4, U5 en U6. U2 en U6 beginnen met de splitsing. De verwijdering van introns uit pre-mRNA-moleculen wordt bereikt op basis van drie sequenties. Ze zijn een 5'-splitsingsplaats, een vertakkingspunt en een 3'-splitsingsplaats. Typisch beginnen introns met een GT en eindigen met een AT. De alternatieve splitsing wordt bereikt door de complementaire basenparing van een GT-site met een AT-plaats van een ander intron. Ongeveer 15% enkele puntmutaties in het pre-mRNA kunnen het proces van splitsing beïnvloeden. De RNA-splitsing wordt getoond in Figuur 1. 

Wat is SnoRNA

Klein nucleolair RNA (SnoRNA) is het andere type van klein niet-coderend RNA dat betrokken is bij de modificatie en verwerking van rRNA- en tRNA-voorlopers. De belangrijkste functie van het snoRNA is de rijping van rRNA tijdens de vorming van het ribosoom. Het snoRNA is ook betrokken bij mRNA-bewerking en genoomimprimering. Het snoRNA kan 80 tot 1000 nucleotiden lang zijn in gist.

Figuur 2: Secundaire structuur van de snoRNA van de C / D-box

Twee typen van snoRNA kunnen worden geïdentificeerd op basis van de verschillende en evolutionair geconserveerde sequentie-elementen die aanwezig zijn in elk snoRNA. Dit zijn de C / D-box en H / ACA-box-snoRNA's. De C / D-box is betrokken bij de 2'-O-methylatie en de H / ACA-box is betrokken bij de pseudo-uridylatie. Sommige van de snoRNA's zijn alomtegenwoordig, andere zijn weefselspecifiek en de andere zijn bedrukt. De secundaire structuur van de C / D-box snoRNA wordt weergegeven in Figuur 2. 

Overeenkomsten tussen snRNA en snoRNA

• snRNA en snoRNA zijn soorten klein niet-coderend RNA in de cel.
• Zowel snRNA als snoRNA zijn betrokken bij het modificeren van RNA in de kern.
• De gefosforyleerde adapter voor nucleaire export (PHAX) is betrokken bij het transport van elk snRNA en snoRNA naar de actielocatie in de kern.

Verschil tussen snRNA en snoRNA

Definitie

snRNA: snRNA is een klasse van klein RNA gevonden in de kern van eukaryoten, betrokken bij de pre-mRNA-verwerking.

snoRNA: snoRNA is een type klein RNA, dat de chemische modificaties van rRNA en andere RNA's zoals tRNA en snRNA stuurt.

Betekent

snRNA: snRNA staat voor klein nucleair RNA.

snoRNA: snoRNA staat voor klein nucleolair RNA.

Gevonden in

snRNA: snRNA is alleen te vinden in eukaryoten.

snoRNA: snoRNA is te vinden in zowel eukaryoten als archaea.

Grootte

snRNA: snRNA-molecuul is 80 tot 350 nucleotiden lang.

snoRNA: snoRNA is 80 tot 1000 nucleotiden lang in gist.

Functie

snRNA: siRNA is betrokken bij alternatieve splitsing in eukaryoten.

snoRNA: snoRNA is betrokken bij het bewerken van mRNA, het modificeren van rRNA en tRNA en het inprenten van het genoom.

Conclusie

snRNA en snoRNA zijn twee soorten klein, niet-coderend RNA die betrokken zijn bij de verwerking van precursor-RNA. Het snRNA is betrokken bij de splitsing van eukaryotisch mRNA tijdens post-transcriptionele modificaties. Het snoRNA is betrokken bij de rijping van rRNA en tRNA. Daarom is het belangrijkste verschil tussen snRNA en snoRNA hun functie in de precursor-RNA-verwerking.

Referentie:

1. "SnRNA's zijn vereist voor het verbinden." CELLEN. N.p., n.d. Web. Beschikbaar Hier. 24 juli 2017. 
2. "Eukaryote snoRNA's: een paradigma voor flexibiliteit van genexpressie." ScienceDirect. N.p., n.d. Web. Beschikbaar Hier. 24 juli 2017. 
3. "MEER FUNCTIONELE RNA-MOLECULEN." GENETICA. N.p., n.d. Web. Beschikbaar Hier. 24 juli 2017. 

Afbeelding met dank aan:

1. "RNA splicing diagram en" door LadyofHats (Public Domain) via Commons Wikimedia
2. "RF00071" - ontleend aan de Rfam-database (Public Domain) via Commons Wikimedia