Verschil tussen sgRNA en gRNA

sgRNA is het single guide RNA, een term die wordt gebruikt om gRNA te beschrijven, terwijl gRNA het geleide RNA is, een RNA-molecuul dat wordt gebruikt om een ​​bepaald doelwit voor de endonucleasen in de op CRISPR-systeem gebaseerde genoombewerking te specificeren. daarom, zowel sgRNA als gRNA zijn onderling uitwisselbare termen die worden gebruikt om hetzelfde molecuul te beschrijven. Er is niet veel verschil tussen sgRNA en gRNA.

Zowel sgRNA en gRNA zijn synthetische moleculen en lijken qua functie op het crRNA in het CRISPR-systeem. 

Key Areas Covered

1. Wat is sgRNA
     - Definitie, betekenis
2. Wat is gRNA
     - Definitie, structuur, functie
3. Wat zijn de overeenkomsten tussen sgRNA en gRNA
     - Overzicht van gemeenschappelijke functies
4. Wat is het verschil tussen sgRNA en gRNA
     - Vergelijking van belangrijke verschillen

Sleutelbegrippen

Cas, CRISPR-gebaseerde genoombewerking, gRNA, sgRNA, spacer-sequentie 

Wat is sgRNA 

sgRNA (single guide RNA) is een andere term die wordt gebruikt om gRNA te beschrijven. 

Figuur 1: sgRNA

Wat is gRNA 

gRNA (guide RNA) is een korte, synthetische RNA-molecule die wordt gebruikt in de CRISPR-systeemgebaseerde genoombewerking, een van de zeer specifieke soorten genoommodificatietool. gRNA bestaat uit een ~ 20 bp lange nucleotidesequentie die bindt aan een doel-DNA-sequentie van het genoom. Deze reeks wordt de spacer volgorde. Het gRNA-molecuul is samengesteld uit een scaffold-sequentie voor de binding van Cas, het endonuclease. De twee componenten van de op CRISPR gebaseerde genoombewerking zijn dus het gRNA en het CRISPR-geassocieerde endonuclease (Cas). Aan de andere kant verandert het genoomdoelwit van het CRISPR-systeem met de sequentie van het gRNA. 

Figuur 2: gRNA-rol in genoombewerking

Drie soorten gRNA's zijn er op basis van de synthesemethode. Ze zijn het synthetische crRNA, lentivirale sgRNA en synthetische sgRNA.  

Overeenkomsten tussen sgRNA en gRNA 

  • sgRNA en gRNA zijn kleine RNA-moleculen die worden gebruikt om de doelsequentie voor de endonucleasen in de genoombewerkingshulpmiddelen op basis van het CRISPR-systeem te specificeren. 
  • Beide hebben een 20 bp gebied dat hybridiseert met DNA. 
  • Beide zijn kunstmatige moleculen en komen niet voor in de natuur. 
  • Beide voeren dezelfde functie uit, d.w.z. de functie crRNA presteert in het natuurlijke CRISPR-systeem. 

Verschil tussen sgRNA en gRNA 

Definitie 

sgRNA (single guide RNA) verwijst naar het gRNA dat wordt gebruikt in het kunstmatige CRISPR-systeem, terwijl gRNA (guideruis) verwijst naar de korte, synthetische RNA-sequenties die de doelsequentie specificeren voor op CRISPR gebaseerde genoombewerking. 

  • Zowel sgRNA als gRNA zijn onderling uitwisselbare termen die worden gebruikt om hetzelfde molecuul te beschrijven

Conclusie 

sgRNA is een andere term voor gRNA, terwijl gRNA de korte, synthetische RNA-sequenties is die worden gebruikt om de doelsequentie in het genoom voor het endonuclease in het CRISPR-systeem te specificeren. Zowel sgRNA als gRNA zijn een van de componenten van de op CRISPR gebaseerde genoombewerking. Daarom is het belangrijkste verschil tussen sgRNA en gRNA alleen de terminologie. 

Referentie:

1. "CRISPR-handleiding." Addgene: CRISPR-handleiding, Beschikbaar Hier

Afbeelding met dank aan:

1. "15 Hegasy Cas9 DNA-tool Wiki E CCBYSA" door Guido4 - Eigen werk (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia 
2. "CRISPR-Cas9-bioloog" door J LEVIN W - Eigen werk (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia