Verschil tussen selecteerbare marker en Reporter-gen

De grootste verschil tussen selecteerbare marker en reportergen is dat het selecteerbare marker wordt gebruikt om onderscheid te maken tussen transformanten en niet-transformanten, terwijl het reportergen wordt gebruikt voor het meten van het niveau van expressie van het getransformeerde gen. Verder heeft het selecteerbare merkergen zijn eigen promotor, terwijl de expressie van het reportergen wordt gereguleerd door de promoter van het getransformeerde gen.

Selecteerbare maker en reportergen zijn twee soorten genen die worden gebruikt om transformanten te analyseren in de onderzoeken die transgene organismen produceren.

Key Areas Covered

1. Wat is een selecteerbare marker
     - Definitie, doel, voorbeelden
2. Wat is een Reporter-gen
     - Definitie, doel, voorbeelden
3. Wat zijn de overeenkomsten tussen selecteerbare marker en Reporter gen
     - Overzicht van gemeenschappelijke functies
4. Wat is het verschil tussen selecteerbare marker en Reporter gen
     - Vergelijking van belangrijke verschillen

Sleutelbegrippen

Genexpressieanalyse, gen van interesse, Reportergen, selecteerbare marker, transformanten

Wat is een selecteerbare marker

Selecteerbare marker is een type markergenen die zich over het algemeen in het plasmide bevinden. Het wordt met behulp van het plasmide in de gastheercel getransformeerd. De transformanten die de selecteerbare marker bevatten, kunnen groeien in het corresponderende selecteerbare medium. Maar de niet-transformanten, die de selecteerbare marker missen, kunnen niet groeien in dat selecteerbare medium. Dit betekent dat het genproduct van de selecteerbare marker de selectiefactor voor de overleving wordt.

De drie groepen van selecteerbare merkers zijn antibioticumresistentiegenen, antimetabolietmerkgenen en herbicideresistentiegenen. Meest gebruikte selecteerbare markers zijn de antibioticumresistentiegenen. Derhalve kunnen alleen de transformanten groeien in het medium, dat het overeenkomstige antibioticum bevat.

Selecteerbare markering 

Figuur 1: Rol van antibiotica-resistente genen bij moleculair klonen

Alle transformanten kunnen echter niet het gen van interesse bevatten. Sommige transformanten hebben mogelijk alleen de vector met de selecteerbare marker. Sequentiebepaling of analyse van genexpressie maakt alleen de detectie van recombinanten die het gen van belang hebben mogelijk.

Wat is een Reporter-gen

Reportergen is een type markergenen die worden gebruikt om de genexpressie te kwantificeren. Ze zijn gefuseerd aan de regulerende sequentie van het gen van belang. Afgezien van de analyse van de expressie van het gen van belang laten reportergenen het bestuderen van de functie van de genregulerende elementen en het effect van transcriptiefactoren op de genexpressie toe. Ook zijn reportergenen essentieel bij de identificatie van de weefselspecifieke of pathway-specifieke genexpressie.

Figuur 2: Rol van het Reporter-gen

Groen fluorescerend eiwit (GFP) en luciferase zijn het meest voorkomende type reportergenen. GFP is een gloeiend eiwit onder UV-licht. De aanwezigheid van andere fluorescerende eiwitten zoals rode en gele fluorescerende eiwitten maken de identificatie van verschillende eiwitten in hetzelfde systeem mogelijk. Luciferase is een enzym dat de productie van geelgroen of blauw licht uit het substraat luciferine katalyseert.

Overeenkomsten tussen selecteerbare marker en Reporter gen

• Selecteerbare marker en reportergen zijn twee soorten markergenen die worden gebruikt om transformanten te analyseren.
• Ze worden samen met het gen van belang getransformeerd in het gastheerorganisme.
• Beide soorten reportergenen zijn onder normale omstandigheden niet in de gastheercel aanwezig. Daarom zijn ze vreemd voor de gastheercel.

Verschil tussen selecteerbare marker en rapportgen

Definitie

De selecteerbare marker verwijst naar een gen waarvan de expressie het mogelijk maakt cellen te identificeren die zijn getransformeerd of getransfecteerd met een vector die het markergen bevat, terwijl het reportergen verwijst naar een gen dat wordt gebruikt om een ​​ander gen of andere interessante DNA-sequentie te 'taggen', zoals een promotor.

Belang

Selecteerbare marker helpt om onderscheid te maken tussen transformanten en niet-transformanten, terwijl reportergen helpt om de hoeveelheid expressie van het getransformeerde gen te meten.

promotor

De selecteerbare marker heeft zijn eigen promotor, terwijl het reportergen wordt gereguleerd onder de promotor van het getransformeerde gen.

Plaats

Selecteerbare maker kan in het plasmide zijn of in het genconstruct, terwijl het reportergen tussen de promotor en het gen van belang is.

Resultaat

Getransformeerde cellen met de selecteerbare maker kunnen groeien in het selecteerbare medium maar de niet-transformant kan niet groeien omdat ze de selecteerbare marker missen, terwijl de hoeveelheid genproduct in het reportergen afhangt van de hoeveelheid met succes getransformeerde genen van belang.

Voorbeelden

Antibioticaresistentiegenen, antimetabolietmerkgenen en herbicideresistentiegenen zijn het type selecteerbare markers, terwijl GFP en Luciferase enkele reportergenen zijn.

Conclusie

De selecteerbare markers zijn de markergenen die worden gebruikt om transformanten in het overeenkomstige selecteerbare medium te screenen, terwijl de reportergenen markergenen zijn om de hoeveelheid expressie te meten. Het belangrijkste verschil tussen selecteerbare marker en reportergenen is het type screening.

Referentie:

1. Jha, Nandkishor. "Selecteerbare merker-genen en Reporter-genen." Biologie Discussie, 16 oktober 2015, hier beschikbaar
2. "Reporter Gene Assays." Thermo Fisher Scientific, Thermo Fisher Scientific, hier beschikbaar

Afbeelding met dank aan:

1. "Stappen van moleculair klonen" door Alexpicardal97 - Eigen werk (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia 
2. "Reporter-gen" door TransControl op en.wikipedia (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia