Retrovirus en bacteriofaag zijn twee soorten virussen. Virussen zijn eenvoudige organismen die bestaan uit een kern van genetisch materiaal, DNA of RNA, omgeven door een proteïne-capside. Ze hebben een gastheer nodig om hun levenscyclus te voltooien. Daarom worden virussen beschouwd als intracellulaire parasieten. Gewoonlijk infecteren retrovirussen planten- en dierencellen en bacteriofagen infecteren bacteriën. Maar retrovirussen, profeten genoemd, infecteren bacteriën in zeldzame gevallen. De grootste verschil tussen retrovirus en bacteriofaag is dat retrovirussen bestaan uit een enkelstrengig, positief sense RNA-molecuul als hun genetisch materiaal, terwijl bacteriofagen bestaan uit enkelstrengs of dubbelstrengs DNA- of RNA-genomen.
Dit artikel kijkt naar,
1. Wat is Retrovirus
- Definitie, kenmerken, functies, voorbeelden
2. Wat is Bacteriophage
- Definitie, kenmerken, functies, voorbeelden
3. Wat is het verschil tussen Retrovirus en Bacteriophage
Elk virus dat behoort tot de familie retroviridae, dat de genetische blauwdruk in de vorm van RNA draagt, wordt geïdentificeerd als een retrovirus. Retrovirussen bestaan uit hun eigen reverse transcriptase-enzym om DNA te produceren uit het enkelstrengige, positief-sense-RNA-genoom. Reverse transcriptie is het omkeerproces naar de cellulaire transcriptie die gewoonlijk DNA in RNA transcribeert. Reverse transcriptase maakt het RNA-genoom van het retrovirus echter beschikbaar in de vorm van DNA dat permanent kan worden opgenomen in het gastheergenoom. De incorporatie van het retrovirale DNA (provirus) in het gastheergenoom wordt uitgevoerd door integrase. Genen van het retrovirus worden tot expressie gebracht met behulp van de genexpressiemechanismen van de gastheer. Vanwege dit succesvolle genafgiftemechanisme van retrovirussen, worden ze gebruikt als een krachtig hulpmiddel voor genoverdracht in Molecular Biology.
Humaan T-cel lymfotroop virus type 1 (HTLV-1) vormt een kanker die volwassen T-celleukemie (ALT) bij mensen wordt genoemd. Het is het eerste menselijke virus dat werd ontdekt bij mensen. Menselijk immunodeficiëntievirus (HIV) is een ander type retrovirus dat bij de mens het acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) veroorzaakt. Menselijk endogeen retrovirus (HERV's) gas wordt een fossiel virus in het menselijk genoom over de oorzaak van de evolutie. Het impliceert verschillende ziekten zoals multiple sclerose. De structuur van het HIV wordt getoond in Figuur 1.
Figuur 1: HIV
Elke groep virussen die bacteriën infecteren, wordt bacteriofagen of bacteriële virussen genoemd. Bacteriofagen zijn ook in staat om archaea te infecteren. Het genetische materiaal van fagen kan DNA of RNA zijn en enkelstrengs of dubbelstrengs. Fagen worden ingedeeld in verschillende families zoals Inoviridae, Microviridae, Rudiviridae en Techtiviridae. Er zijn drie structurele basisvormen: icosaëder met een staart, icosaëdrische zonder staart en filamenteus. Tijdens faagtherapie worden bacteriofagen gebruikt om zich te richten op multi-drug-resistente stammen van ziekteverwekkende bacteriën. Bacteriofagen zoals lambda, M13 en MU worden gebruikt in recombinant DNA-technologie. De structuur van een typische bacteriofaag met de staart wordt getoond in Figuur 2.
Figuur 2: Typische bacteriofaag met staart
Zodra een faag een bacterie infecteert, wordt een van de twee levenscycli, ofwel lytisch of lysogeen, gevolgd door de faag. Lytische fagen overnemen van cellulaire machinerie om faagcomponenten te produceren. De afgifte van de nieuwe fagen lyses de geïnfecteerde cel. Maar, lysogene fagen incorporeren hun nucleïnezuren in het bacteriële genoom en repliceren samen met de bacterie. Onder bepaalde omstandigheden worden lysogene fagen geïnduceerd om lytische fagen te worden. Andere levenscycli van de faag omvatten pseudolysogenie en chronische infectie. Fagen worden bewaard door psedolysogeny om ongunstige groeiomstandigheden van de gastheer te ondergaan. In een chronische infectie, Nieuwe faagdeeltjes worden continu geproduceerd over een aanzienlijke tijdsperiode zonder de geïnfecteerde gastheercellen te vernietigen.
retrovirus: Elk virus dat behoort tot de groep retroviridae die de genetische blauwdruk in de vorm van RNA draagt, wordt geïdentificeerd als een retrovirus.
bacteriofaag: Elke groep virussen die bacteriën infecteren, wordt bacteriofagen genoemd.
retrovirus: Retroviraal genoom bestaat uit enkelstrengs, positief sense RNA.
bacteriofaag: Deze bestaat uit enkelstrengs of dubbelstrengs DNA- of RNA-genomen.
retrovirus: Het RNA-genoom van het retrovirus wordt omgekeerd getranscribeerd in DNA dat zich permanent hecht aan het gastheergenoom. Retrovirale genen worden samen met de gastheergenen tot expressie gebracht.
bacteriofaag: Bacteriofagen vertonen lytische of lysogene levenscycli.
retrovirus: Retrovirus bevat hun eigen reverse transcriptase-enzym.
bacteriofaag: Bacteriofagen bevatten geen reverse transcriptase.
retrovirus: Retrovirussen hechten zich aan plasmamembraaneiwitten en glycoproteïnen.
bacteriofaag: Staartvezels van de bacteriofaag hechten zich aan celwandproteïnen van de bacteriën.
retrovirus: Retroviraal capside komt de cel binnen via endocytose of fusie.
bacteriofaag: Viraal DNA wordt door bacteriofagen in de bacterie geïnjecteerd.
retrovirus: Capsideproteïnen van het retrovirus worden na penetratie verwijderd door enzymatische reacties.
bacteriofaag: Omdat het virale genoom direct wordt geïnjecteerd, is capside niet-coaten vereist in de gastheer.
retrovirus: Retrovirale biosynthese vindt plaats in de kern in DNA-virussen en in het cytoplasma in RNA-virussen.
bacteriofaag: Bacteriofaag-synthese vindt plaats in het cytoplasma.
retrovirus: Enveloped-retrovirussen zijn uitknopende en niet-omhulde virussen breken het plasmamembraan.
bacteriofaag: Bacteriofagen worden vrijgemaakt uit de lysis van de gastheercel.
Retrovirussen en bacteriofagen zijn twee soorten infectieuze bacteriën. Retrovirussen infecteren planten en dieren, terwijl bacteriofagen bacteriën en archaea infecteren. Retrovirussen bestaan uit RNA in hun genoom. bacteriofagen bestaan uit DNA of RNA in hun genoom. De levenscyclus van de bacteriofaag kan lytisch of lysogeen zijn. Het belangrijkste verschil tussen retrovirus en bacteriofaag is echter in hun gastheren die door elk van de bacteriën zijn geïnfecteerd.
Referentie:
1. "Retrovirus." Encyclopædia Britannica. Encyclopædia Britannica, inc., N.d. Web. 26 mei 2017.
2. "Bacteriophage." Encyclopædia Britannica. Encyclopædia Britannica, inc., N.d. Web. 26 mei 2017.
Afbeelding met dank aan:
1. "HI-virion-structure en" door Thomas Splettstoesser (www.scistyle.com) - Eigen werk (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia
2. "Tevenphage" door Adenosine (origineel); nl: Gebruiker: Pbroks13 (redraw) http://commons.wikimedia.org/wiki/Image:Tevenphage.png (CC BY-SA 2.5) via Commons Wikimedia