Verschil tussen plasmide en Cosmid

Belangrijkste verschil - Plasmid versus Cosmid

Plasmide en cosmide zijn twee van de vier soorten vectoren die kunstmatig vreemd genetisch materiaal in een tweede cel meenemen. Virale vectoren en kunstmatige chromosomen zijn de andere soorten vectoren die vreemd DNA dragen. Vectoren zijn zelfreplicatieve, dubbelstrengige DNA-moleculen. Ze worden veel gebruikt bij het manipuleren van genen in het laboratorium. De grootste verschil tussen plasmide en cosmide is dat plasmide is een lus van dubbelstrengs DNA, van nature aangetroffen in het bacteriële cytoplasma en repliceert onafhankelijk van chromosomen, terwijl cosmide een type plasmide is, geconstrueerd door de insertie van cos sequenties van de X-faag.    

Key Areas Covered 

1. Wat is een plasmide
      - Functies, structuur, gebruik
2. Wat is een Cosmid
      - Functies, structuur, gebruik
3. Wat zijn de overeenkomsten tussen Plasmid en Cosmid
      - Veelvoorkomende eigenschappen
4. Wat is het verschil tussen Plasmid en Cosmid
      - Vergelijking van belangrijke verschillen 

Sleutelbegrippen: Vector, Plasmide, Cosmid, Hybrid Vectors, Double-stranded DNA, Bacteria, Cos site, Insert

Wat is een plasmide

Plasmiden zijn extra-chromosomale, zelf-replicerende, dubbelstrengs, circulaire DNA-moleculen, meestal te vinden in bacteriële cellen. Plasmiden zijn echter niet noodzakelijk voor de overleving van bacteriën onder normale omstandigheden. Ze bevatten de nodige informatie voor antibioticaresistentie, metaalresistentie, stikstoffixatie en toxineproductie. Natuurlijk voorkomende plasmiden kunnen worden gemodificeerd door in vitro technieken zoals codetransformatie. Plasmiden zijn soorten vectoren die worden gebruikt als vehikels om genetische informatie naar een tweede cel te transporteren.

Kenmerken van Plasmids

  • Plasmiden kunnen gemakkelijk uit cellen worden geïsoleerd.
  • Plasmiden zijn in staat zichzelf te repliceren in een cel.
  • Plasmiden bestaan ​​uit een unieke restrictieplaats voor één of meer restrictie-enzymen.
  • Het inbrengen van een vreemd DNA-stuk mag de replicatie-eigenschappen ervan niet veranderen.
  • Plasmiden kunnen sequentieel opnieuw worden ingebracht in nieuwe cellen en de transformanten kunnen worden geselecteerd.
  • Plasmiden komen niet vrij in de natuur voor.

Figuur 1: Een plasmide

Wat is een Cosmid

Cosmids zijn hybride vectoren afgeleid van plasmiden. Ze bevatten cos genen van de A bacteriofaag. De aanwezigheid van de cohesieve eindplaats, cos A in een plasmide maakt het mogelijk dat het plasmide in vivo in virale deeltjes wordt verpakt. Maar cosmiden hebben geen genen die coderen voor virale eiwitten. Daarom is de vorming van virale deeltjes verboden in cosmids. Zowel plasmiden als cosmiden delen de oorsprong van replicatie, een markergen, dat codeert voor antibioticumresistentie, en een speciale plaats voor de insertie van een vreemd DNA-stuk. Bovendien kunnen cosmiden tot 45 kb grote fragmenten bevatten. Omdat cosmide-vectoren grote DNA-fragmenten kunnen invoegen in vergelijking met plasmiden, zijn ze geschikt voor het kloneren van grote zoogdierlijke genen of multi-genfragmenten..

Voordelen van Cosmids

  • Genbibliotheken met kleine kloonleden kunnen met cosmiden in het gehele genoom worden uitgebreid.
  • Een groot gen kan intact worden bestudeerd.
  • Genetische koppelingsstudies kunnen eenvoudig worden uitgevoerd.
  • Transformatie frequentie wordt verhoogd met het gebruik van cosmids.

Figuur 2: A Cosmid

Overeenkomsten tussen plasmide en cosmid

  • Plasmiden en cosmiden zijn vectoren die kunstmatig vreemd genetisch materiaal in een tweede cel meenemen.
  • Zowel plasmiden als cosmiden zijn circulaire, dubbelstrengige DNA-moleculen.
  • Beide worden gebruikt als kloneringsvectoren in genetische manipulatie.

Verschil tussen plasmide en Cosmid

Definitie

Plasmid: Plasmide is een genetische structuur in de cel die onafhankelijk van het chromosoom kan repliceren.

cosmide: Cosmid is een type hybride plasmide dat X-faag bevat cos sequenties. 

Correspondentie

Plasmid: Plasmide is een type kloneringsvector.

cosmide: Cosmid is een hybride kloneringsvector.

Cohesive End-sites

Plasmid: Plasmiden hebben geen samenhangende eindplaatsen.

cosmide: Cosmids bevatten een cohesieve eindplaats, waardoor het plasmide in een virusdeeltje kan worden verpakt.

Grootte van de invoeging

Plasmid: Plasmide kan een DNA-stuk tot 15 kb herbergen.

cosmide: Cosmids kunnen tot 45 kb grote fragmenten bevatten.

Transformatie frequentie

Plasmid: De transformatiefrequentie van plasmiden is laag.

cosmide: De transformatiefrequentie van cosmide is hoger dan die van plasmiden.

Voorbeelden

Plasmid: pBR322, pBG1805 en pYES2.1 zijn de voorbeelden van plasmiden.

cosmide: De pHV79 is een van de meest voorkomende cosmiden die wordt gebruikt in genetische manipulatie.

Conclusie

Plasmide en cosmide zijn twee dragers van kunstmatig DNA tussen cellen. Een plasmide is een circulair, dubbelstrengig DNA-molecuul, dat een plaats omvat voor de insertie van een vreemd DNA-stuk dat moet worden getransformeerd. Cosmids zijn gemodificeerde plasmiden die bevatten cos sites van de bacteriofaag A. Vanwege de aanwezigheid van cos plaats is cosmid in staat om in een virusdeeltje te verpakken. Op grond hiervan kunnen cosmiden grote DNA-deeltjes accommoderen in vergelijking met plasmiden. Het grootste verschil tussen plasmide en cosmide zit dus in hun structuur.

Referentie:

1. "Nuttige opmerkingen over 4 categorieën vectoren (DNA's voor voertuigen - Plasmiden, bacteriofagen, kosmiden en phasmiden)." DEEL JE ESSAYS. N.p., 19 september 2015. Web. Beschikbaar Hier. 6 juni 2017. 
2. "Kloneringsvectoren die worden gebruikt in recombinante DNA-technologie: 3 kloneringsvectoren." Biology Discussion. N.p., 16 oktober 2015. Web. Beschikbaar Hier. 6 juni 2017.