Metabolisme verwijst naar een verzameling biochemische transformaties die in levende organismen voorkomen. De complete set metabolieten in een levend organisme staat bekend als het metaboloom. Metabolomics en metabonomics zijn twee soorten nauw verwante studies van het metaboloom. Zowel metabolomics en metabonomics zijn kwantitatieve studies. De grootste verschil tussen metabolomics en metabonomics is dat metabolomics is de studie van het metaboloom, terwijl metabonomie de multiparametrische metabole responsen is van een bepaald levend organisme op pathogene stimuli of genetische modificatie. De detectie en analyse van metabolieten van een bepaald organisme gebeurt met behulp van NMR-spectroscopie en massaspectroscopie (MS).
1. Wat is Metabolomics
- Definitie, analyse, rol
2. Wat is Metabonomics
- Definitie, analyse, rol
3. Wat zijn de overeenkomsten tussen metabolomics en metabonomics
- Overzicht van gemeenschappelijke functies
4. Wat is het verschil tussen Metabolomics en Metabonomics
- Vergelijking van belangrijke verschillen
Sleutelbegrippen: massaspectroscopie, metabolieten, metaboleoom, metabolomics, metabonomica, NMR-spectroscopie
Metabolomics verwijst naar een wetenschappelijke studie van de verzameling metabolieten die aanwezig is in een cel, weefsel of organisme. In metabolomics worden de concentraties en de locaties van alle metabolieten (metaboloom) in een cel onderzocht. Als een voorbeeld kwantificeert het het aantal enzymen in een cel. NMR-spectrometrie is de belangrijkste techniek die betrokken is bij metabolieten. NMR-spectrometrie is betrokken bij het niet-destructieve onderzoek van biologische vloeistoffen of intacte weefsels. Het basisschema van metabolomics wordt getoond in Figuur 1.
Figuur 1: Metabolomics-schema
De vier belangrijkste benaderingen van metabolomics zijn doelanalyse, metabolietprofilering, metabolomics en metabolomics fingerprinting. Target analyse is betrokken bij de bepaling en kwantificatie van metabolieten. Metabolite profilering is de studie van een groot aantal metabolieten. metabolomics is de analyse van metabolieten door verschillende scheiding- en kwantificatietechnieken. Metabolomics-vingerafdrukken is het gebruik van de signatuur of het massaprofiel van een bepaald organisme om te vergelijken met een grote populatie.
Metabonomie verwijst naar de kwantitatieve meting van de multiparametrische metabole responsen van levende systemen op patho-fysiologische stimuli of genetische modificatie. Het is een subset van metabolomics. De chronische blootstelling aan een toxine of de metabolieten die de makers zijn van een bepaalde ziekte kunnen worden geïdentificeerd in de metabonomie. Het veranderde metabolisme van een cel door choleratoxine is weergegeven in Figuur 2.
Figuur 2: Veranderd metabolisme door Cholera toxine
High-throughput-technieken zoals massaspectroscopie worden gebruikt in de metabonomie om zowel intracellulaire moleculen als extracellulaire biovloeistoffen te analyseren. De geïoniseerde chemicaliën worden herkend op basis van de massa-tot-charge-verhouding in massaspectroscopie. Metabonomics is voornamelijk betrokken bij de bepaling van de verandering in de metabolieten onder veranderde omstandigheden.
metabolomics: Metabolomics verwijst naar een wetenschappelijke studie van de verzameling metabolieten die aanwezig is in een cel, weefsel of organisme.
Metabonomics: Metabonomics verwijst naar de kwantitatieve meting van de multiparametrische metabole responsen van levende systemen op patho-fysiologische stimuli of genetische modificatie.
metabolomics: Metabolomics is de studie van biochemische profielen van een bepaald levend organisme.
Metabonomics: Metabonomics is de studie van metabole responsen van een organisme op externe stimuli.
metabolomics: Metabolomics is de studie van het metaboloom van een bepaald organisme.
Metabonomics: Metabolomics is de subset van metabolomics.
metabolomics: Metabolomics wordt gebruikt in functionele genomica om het fenotype te bepalen.
Metabonomics: Metabonomics wordt gebruikt in toxicologie en ziektediagnostiek.
metabolomics: NMR-spectroscopie is meer betrokken bij metabolomics.
Metabonomics: Massaspectroscopie is meer betrokken bij metabonomieën.
Metabolomics en metabonomics zijn twee soorten studies over het metaboloom van een bepaald organisme. Metabolomics is betrokken bij de analyse van de biochemische profielen van het organisme onder normale omstandigheden. Metabonomica is echter betrokken bij de analyse van het biochemische profiel van een bepaald organisme onder zieke omstandigheden of genetische modificaties. Daarom is het belangrijkste verschil tussen metabolomics en metabonomics het soort condities dat wordt gebruikt in de studie van het metaboloom.
1. "Wat is metabolomics eigenlijk?", Biotechniques. Beschikbaar Hier.
2. Ramsden, Jeremy J. "Metabolomics and Metabonomics." SpringerLink, Springer, Londen, 1 januari 1970, hier beschikbaar.
1. "Metabolomics schema" door Lmaps (bespreking) (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. "Cholera-toxine" door Jessica Brochu - Eigen werk (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia