De belangrijk verschil tussen invoegings- en vervangingsvectoren is dat de invoegvector het vermogen heeft om gematigde lengtes vreemd DNA in te brengen, terwijl vervangingsvector het vermogen heeft om grotere lengtes vreemd DNA te accommoderen.
Faagvectoren zijn de bacteriofagen die worden gebruikt voor klonen. Er zijn twee soorten faagvectoren; ze zijn insertievector en vervangingsvector. Alle faagvectoren bestaan ook uit niet-essentiële genen. Deze genen moeten echter uit fagen worden verwijderd om nieuwe vreemde DNA-inserts te vergemakkelijken.
1. Overzicht en belangrijkste verschil
2. Wat zijn invoegvectoren
3. Wat zijn vervangende vectoren
4. Overeenkomsten tussen invoeg- en vervangingsvectoren
5. Vergelijking zij aan zij - Insertie versus vervangende vectoren in tabelvorm
6. Samenvatting
Allereerst is insertievector de eenvoudigste vorm van lambda-kloneringsvectoren. In feite is het een type faagvector die een unieke restrictieplaats heeft geïntroduceerd in het vectorgenoom op de positie van optioneel DNA. Verder blijft het faag-DNA zonder verwijdering. Deze niet-verwijdering van het faag-DNA beperkt de grootte van de inserties (vreemd DNA) die in de vector moeten worden gekloneerd. Bovendien zijn deze vectoren bruikbaar bij cDNA-klonering en expressie. GT10, GT11 en Zap zijn voorbeelden van deze vector.
Figuur 01: Lambda Phage
Insertievector bestaat uit een enkele herkenningssite. De primaire functie van deze vector is om cDNA-bibliotheken te ontwikkelen die zijn afgeleid van eukaryote mRNA-sequenties. Bovendien kan het alleen lengtes vreemd DNA tussen 05-11 kb omvatten. Ook bezit het een unieke splitsingsplaats voor de insertie van vreemd DNA.
Vervangingsvector of substitutievector is een type faagvector ontwikkeld uit de verwijdering van een midden 'vulfragment' gebied van faag-DNA. Het gewenste vreemde DNA-insert vervangt het faag-DNA.
Figuur 02: Vervangingsvector
Vervangingsvectoren zijn belangrijk bij het creëren van genoombibliotheken zoals EMBL4 en Charon40. Deze vectoren kunnen een groter aantal vreemd DNA bevatten, variërend tussen 8-24 kb-lengten. Het vulgebied bestaat ook uit een gen dat de faagvector niet-levensvatbaar maakt in een bacteriële gastheer.
Invoeging versus vervangende vectoren | |
Insertievector is een type faagvector die een restrictieplaats heeft geïntroduceerd in het faaggenoom op de plaats van optioneel DNA. | Vervangingsvector is een type faagvector ontwikkeld uit de verwijdering van een midden 'vulstuk' gebied van faag-DNA |
Grootte van invoegfragmenten | |
05-11 kb lengte | Lengte van 08-24 kb |
Filler Fragment | |
Geen filler-fragment | Filler-fragment wordt vervangen door een vreemd insert |
Functie | |
Belangrijk om cDNA-bibliotheken te maken | Belangrijk bij het maken van genoombibliotheken |
Voorbeelden | |
GT10, GT11 en Zap zijn voorbeelden | EMBL4 en Charon40 zijn voorbeelden |
Cleavage Site | |
Een unieke splitsingssite is aanwezig | Splitsingsplaats bevat genen die niet essentieel zijn voor de lytische cyclus |
Zowel insertie- als vervangingsvectoren zijn twee typen faagvectoren. Beide vectoren hebben restrictieplaatsen die de accommodatie van nieuwe vreemde DNA-inserts vergemakkelijken. Insertievectoren zijn belangrijk bij het creëren van cDNA-bibliotheken, terwijl vervangingsvectoren belangrijk zijn bij het creëren van genomische bibliotheken. Bovendien zijn insertievectoren geschikt voor DNA-inserts met een gemiddelde lengte. Maar vervangingsvectoren kunnen hogere lengtes van vreemde DNA-inserts accommoderen. In het algemeen is dit het belangrijkste verschil tussen insertie- en vervangingsvectoren.
1. Hasty, P, et al. "Efficiëntie van insertie versus vervanging Vector targeting verschilt op verschillende chromosomale loci." Moleculaire en cellulaire biologie, U.S. National Library of Medicine, december 1994, Beschikbaar Hier.
2. "Lambda Insertion Vectors." Biology 335 Lecture Notes - Lambda Vectors, Beschikbaar Hier.
3. "Vervangingsvector." Vervangingsvector - Terminologie van moleculaire biologie voor vervangende vector - GenScript, Beschikbaar Hier.
1. "Lambda fage" door Lizanne Koch - eigen werk met ChemBioDraw (Public Domain) via Commons Wikimedia