Verschil tussen algemene en specifieke transcriptiefactoren

Belangrijkste verschil - Algemeen versus specifieke transcriptiefactoren

Transcriptiefactoren zijn vereist door RNA-polymerase om in te werken op de DNA-matrijsstreng bij het synthetiseren van mRNA. Er zijn verschillende soorten transcriptiefactoren. Deze transcriptiefactoren vormen een complex met de DNA-streng. Ze veranderen de bevestiging van de matrijsstreng of verhogen de affiniteit van het RNA-polymerase-enzym ten opzichte van mRNA-synthese bij het proces van geroepen transcriptie. Er zijn twee hoofdtypen transcriptiefactoren. Dit zijn algemene of basale transcriptiefactoren en de specifieke transcriptiefactoren. De algemene transcriptiefactoren zijn de factoren die worden gebruikt om het pre-initiatiecomplex te vormen tijdens het proces van transcriptie. Ze zijn aanwezig in bijna alle eukaryoten, en in prokaryoten vormen ze een minder gecompliceerd complex. De specifieke transcriptiefactoren zijn ofwel versterkers of repressors, die specifieke DNA-sequenties zijn die het algemene transcriptieproces activeren of onderdrukken. Sommige specifieke transcriptiefactoren kunnen de DNA-sequentie zelf veranderen. De belangrijk verschil tussen de algemene transcriptiefactoren en de specifieke transcriptiefactoren is gebaseerd op de functionaliteit. Algemene transcriptiefactoren zijn betrokken bij de vorming van een pre-initiatiecomplex van het transcriptieproces, terwijl specifieke transcriptiefactoren deelnemen aan het activeren of onderdrukken van het transcriptieproces..

INHOUD

1. Overzicht en belangrijkste verschil
2. Wat zijn algemene transcriptiefactoren
3. Wat zijn specifieke transcriptiefactoren
4. Overeenkomsten tussen algemene en specifieke transcriptiefactoren
5. Vergelijking zij-aan-zij - Algemene versus specifieke transcriptiefactoren in tabelvorm
6. Samenvatting

Wat zijn algemene transcriptiefactoren?

Algemeen of Basale transcriptiefactoren zijn de factoren die betrokken zijn bij de vorming van het initiatiecomplex tijdens transcriptie. Ze zijn essentieel voor het transcriptieproces en spelen daarom een cruciale rol in de succesvolle transcriptie. Er zijn zes belangrijke algemene transcriptiefactoren. Zij zijn; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF en TFIIA. Ze spelen verschillende rollen tijdens de vorming van het initiatiecomplex.

TFIID - Deze transcriptiefactor (TF) is betrokken bij het herkennen van de promotersequentie (TATA-box).
TFIIB - Het promotor / TFIID-complex wordt door TFIIB herkend. Dit verschaft een signaal voor de binding van het RNA-polymerase van het hoofdkatalyserende enzym.
TFIIF - Deze transcriptiefactor is gebonden aan het RNA-polymerase. TFIIF neemt aldus deel aan het proces door het RNA-polymerase naar de juiste locatie te rekruteren.
TFIIE en TFIIH - De binding van deze transcriptiefactoren markeert het einde van de vorming van de pre-initiatie Binding van deze verhoogt de efficiëntie van de vorming van het pre-initiatiecomplex.
TFIIA bevordert de binding van TFIID aan de TATA-box.

Figuur 01: Algemene transcriptiefactoren

De bovengenoemde algemene transcriptiefactoren zijn specifiek voor RNA-polymerase II, wat het type RNA-polymerase is dat de mRNA-streng verlengt. Er zijn algemene transcriptiefactoren betrokken bij RNA-polymerase I en III. Algemene transcriptiefactoren kunnen ook verschillen afhankelijk van het type cel waarop het inwerkt.

Wat zijn specifieke transcriptiefactoren?

Specifieke transcriptiefactoren zijn ook regio's die zich in de DNA-sequenties bevinden. Het zijn meestal enhancers of repressors. Specifieke transcriptiefactoren zijn de specifieke cis-werkende elementen in de matrijs-DNA-streng die transcriptie ondergaan. Activering van deze specifieke versterkers en repressoren neemt deel aan het verhogen van de affiniteit van het enzym door de oriëntatie van het DNA-molecuul te veranderen of door als signaleringsgebieden te werken. Specifieke transcriptiefactoren worden ook gebruikt om modificaties in de DNA-matrijsstreng te induceren. Deze modificaties betreffen voornamelijk covalente modificaties zoals methylatie. Daarbij werken gemethyleerde DNA-regio's als speciale versterkers of repressoren van het transcriptieproces.

Figuur 02: Specifieke transcriptiefactoren

De specifieke transcriptiefactoren zijn afhankelijk van het soort soort en komen niet vaak voor in alle eukaryoten. Deze transcriptiefactoren worden geactiveerd door verschillende metabole condities via signaaltransductieroutes. Na activatie reguleren ze de expressie van het gen op transcriptieniveau.

Wat zijn de overeenkomsten tussen algemene en specifieke transcriptiefactoren?

Beide factoren zijn vereist in het proces van transcriptie.
Beide factoren beïnvloeden de genexpressie van een organisme.
Beide factoren helpen bij het reguleren van de functie van RNA-polymerase in het transcriptieproces.
Beide factoren zijn meestal te vinden in eukaryoten.

Wat is het verschil tussen algemene en specifieke transcriptiefactoren?

Algemene versus specifieke transcriptie
De algemene transcriptiefactoren zijn de factoren die worden gebruikt om het pre-initiatiecomplex te vormen tijdens het proces van transcriptie.	De specifieke transcriptiefactoren zijn ofwel versterkers of repressors, die specifieke DNA-sequenties zijn die het algemene transcriptieproces activeren of onderdrukken..
Type molecuul
Algemene transcriptiefactoren zijn op eiwitten gebaseerd.	Specifieke transcriptiefactoren zijn nucleotidesequenties.
Vorming
Algemene transcriptiefactoren vormen het pre-initiatiecomplex tijdens de transcriptie-initiatie.	Specifieke transcriptiefactoren werken als enhancers of repressors van transcriptie.
Types
Er zijn zes hoofdtypen; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE en TFIIA van algemene transcriptiefactoren.	Specifieke transcriptiefactoren worden hoofdzakelijk gecategoriseerd als enhancers en repressors.

Samenvatting - Algemeen versus specifieke transcriptiefactoren

Transcriptiefactoren zijn essentieel voor de transcriptionele regulatie en zijn vereist voor de verhoogde efficiëntie en nauwkeurigheid van het proces. Transcriptiefactoren zijn twee hoofdtypen; Algemeen / basaal en specifiek. Algemene transcriptiefactoren zijn betrokken bij de vorming van het pre-initiatiecomplex tijdens transcriptie, terwijl specifieke transcriptiefactoren gebieden in het DNA zelf zijn die als versterkers of repressors werken. Algemene transcriptiefactoren zijn op eiwitten gebaseerd en zijn vereist voor alle eukaryoten. Het is niet erg gevarieerd en blijft als uniforme moleculen. Een specifieke transcriptiefactor kan sterk variëren en is afhankelijk van de genetische samenstelling van het individu. Dit is het verschil tussen algemene en specifieke transcriptiefactoren.

Download de PDF-versie van algemene versus specifieke transcriptiefactoren

U kunt de PDF-versie van dit artikel downloaden en gebruiken voor offline doeleinden, zoals per citaatnotitie. Download de PDF-versie hier. Verschil tussen algemene en specifieke transcriptiefactoren

Referentie:

1.Pulverer, Bernd. "Sequentie-specifieke DNA-bindende transcriptiefactoren." Nature News, Nature Publishing Group. Beschikbaar Hier
2. "Transcriptiefactoren - Gen-specifieke factoren differentiëren transcriptietarieven in verschillende mate." DNA, binding, promotor en binding - JRank artikelen. Beschikbaar Hier
3. Orphanides, G, et al. "De algemene transcriptiefactoren van RNA polymerase II." Genes & Development, Cold Spring Harbor Lab. Beschikbaar Hier

Afbeelding met dank aan:

1.'Preinitiation-complex 'door ArneLH - Eigen werk, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. 'Rol van transcriptiefactor in genexpressie-regulering' door Philippe Hupé - Emmanuel Barillot, Laurence Calzone, Philippe Hupé, Jean-Philippe Vert, Andrei Zinovyev, Computational Systems Biologie van kanker Chapman & Hall / CRC Mathematical & Computational Biology, 2012, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia

Moleculaire biologie