Transcriptie is het proces van het omzetten van de genetische informatie die is opgeslagen in de coderende DNA-sequentie in mRNA-sequentie. Een specifiek DNA-gebied aan het 5'-uiteinde van de transcriptie-eenheid initieert dit proces. Die regio staat bekend als de promotorregio. Deze promoters worden kenmerkend grenzend aan de transcriptiestartplaats gevonden. De lengte van een promotor varieert van 100 bp tot 1000 bp. Promoters zijn verschillend volgens het type organisme. Eukaryotische en prokaryote promoters verschillen van elkaar. In prokaryoten worden slechts drie typen promotorsequenties gevonden, namelijk -10 promotors, -35 promotor en stroomopwaartse elementen. In eukaryoten, er zijn veel verschillende promotorelementen zoals TATA-box, initiatorelementen, GC-box, CAAT-box, enz. Dit is de belangrijk verschil tussen eukaryotische en prokaryotische promotors.
1. Overzicht en belangrijkste verschil
2. Wat zijn eukaryotische promoters
3. Wat zijn Prokaryotische Promoters
4. Overeenkomsten tussen eukaryotische en prokaryotische promoters
5. Vergelijking zij aan zij - Eukaryoot versus prokaryotische promoters in tabelvorm
6. Samenvatting
Drie hoofdgedeelten; kernpromoter, proximale promoter en distale promotor, vormen gezamenlijk een promotor. In de context van eukaryoten zijn er veel aantallen promotorelementen gevonden die zeer geavanceerd en meer divers zijn dan promoters. Er is ontdekt dat, vanwege deze complexiteit van de eukaryote promoters, het DNA het vermogen heeft zichzelf terug te vouwen. Dit verklaart ook het feit dat, het effect van veel regulerende sequenties plaatsvindt, ook al bevinden ze zich vele kilobasen verwijderd van de plaats van transcriptie. Deze eukaryote promoters hebben het vermogen om door een breed bereik van DNA-sequenties te overspannen.
Figuur 01: Eukaryotische promotor
Voorbeelden voor sommige eukaryote promoters zijn Pribnow-box (TATA-box), GC-box, CAAT-box enz. In de context van TATA-box, het is een sequentie van 5 '- TATAA -3' die aanwezig is in het kernpromotorgebied. Aan de TATA-box zijn transcriptiefactoreiwitten en histon-eiwitten gebonden. De binding van transcriptiefactoreiwitten aan de TATA-box helpt bij de binding van RNA-polymerase, wat vervolgens resulteert in de vorming van een transcriptiecomplex. In eenvoudige bewoordingen zal de binding van deze eiwitten het proces van transcriptie aansturen. Dit proces zal worden geremd wanneer histone-eiwitten worden gebonden aan de TATA-box. Daarom is de TATA-box een belangrijk promotorelement dat betrekking heeft op regulering van de snelheid van eukaryote transcriptie.
In prokaryotische organismen wordt de promoter die betrokken is bij transcriptie geïdentificeerd door de bijbehorende factor, de sigmafactor. Sigma-factoren zijn uniek voor verschillende promotersequenties. Daarom wordt er gezegd dat elke afzonderlijke sigmafactor een enkele kernpromotersequentie zou herkennen. Dit is een uniek kenmerk dat aanwezig is in het prokaryotische transcriptieproces. Zowel RNA-polymerase als de sigma-factor identificeren gezamenlijk het correcte promotergebied en vormen het transcriptiecomplex.
De prokaryote promoter bevat slechts drie soorten promotorelementen. De minder betrokkenheid van promotorelementen bij prokaryoten is de belangrijkste reden waarom hun transcriptieproces minder geavanceerd is in vergelijking met eukaryote transcriptie die een hoger aantal promotersequenties omvat. Van de drie promotorelementen van prokaryoten zijn er twee belangrijke belangrijke twee korte DNA-sequenties. Deze sequenties worden geclassificeerd op basis van hun locatie. Ze zijn, -10 promoters of element (dat aanwezig is 10bp stroomopwaarts van de startplaats voor transcriptie), -35 promotors of element (dat aanwezig is 35bp stroomopwaarts van startplaats voor transcriptie).
Figuur 02: Prokaryotische promotor
De -10 promoter is equivalent aan de eukaryote TATA-box of Pribnow-box en is een essentiële component voor het initiëren van transcriptie in prokaryoten. De -35-promotor bestaat uit een sequentie die TTGACA is die actief betrokken is bij de regulatie van de snelheid van prokaryotische transcriptie..
Eukaryoten versus prokaryotische promoters | |
Eukaryote promotors zijn de regulerende sequenties die de transcriptie van eukaryote organismen initiëren. | Prokaryotische promoters zijn de regulerende sequenties die de transcriptie van prokaryotische genen initieert. |
Elements | |
Prokaryotische promotor bestaat uit stroomopwaartse elementen, -10 element en -35 elementen. | Eukaryote promotor bestaat uit Pribnow-box (TATA-box), CAAT-box, GC-box en initiatorelementen. |
Een promotor is een regio van DNA dat de initiatie van het proces met de naam transcriptie omvat. Deze promoters worden typisch stroomopwaarts van de transcriptiestartplaats gevonden. De drie hoofddelen die een promotor vormen zijn kernpromoter, proximale promoter en distale promoter. In de context van eukaryoten zijn er veel promotiepunten in de promotorregio die zeer geavanceerd en meer divers zijn dan prokaryoten. Voorbeelden van sommige eukaryote promotorelementen zijn Pribnow-box (TATA-box), GC-box, CAAT-box enz. In prokaryoten zijn er twee belangrijke belangrijke promotorelementen, namelijk -10 element (dat aanwezig is 10 bp stroomopwaarts van transcriptiestartplaats), -35 elementen (dat is aanwezig 35bp stroomopwaarts van startplaats voor transcriptie). -10 promotor initieert de transcriptie en de -35 promoter reguleert de transcriptie. Beide typen promoters worden gecontroleerd door verschillende DNA-regulerende sequenties die versterkers, geluiddempers, isolatoren en grenselementen omvatten. Dit is het verschil tussen eukaryotische en prokaryotische promotors.
U kunt de PDF-versie van dit artikel downloaden en gebruiken voor offline doeleinden volgens citaatnotitie. Download de PDF-versie hier: Verschil tussen eukaryote en prokaryotische promotor
1.Kanhere, A. "Structurele eigenschappen van promoters: overeenkomsten en verschillen tussen prokaryoten en eukaryoten." Nucleic Acids Research, vol. 33, nee 10, februari 2005, blz. 3165-3175., Doi: 10.1093 / nar / gki627.
2. "Promoters." Addgene. Beschikbaar Hier
1.'Gene structure eukaryote 2 geannoteerd 'Door Thomas Shafee - Shafee T, Lowe R (2017). "Eukaryotische en prokaryotische genstructuur". WikiJournal of Medicine 4 (1). DOI: 10,15347 / WJM / 2017,002. ISSN 20024436., (CC BY 4.0) via Commons Wikimedia
2.'Figuur 15 02 01 'Door CNX OpenStax, (CC BY 4.0) via Commons Wikimedia