Verschil tussen genetische kaart en fysieke kaart

De belangrijk verschil tussen Genetic Map en Physical Map zit in de technieken die gebruikt worden bij het in kaart brengen van genoom. Bij het genereren van een genetische kaart worden genetische markers en genetische loci gebruikt om de genverbindingspatronen te bestuderen, terwijl fysische mapping moleculair biologische technieken gebruikt zoals Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) en Hybridization-technieken.

Genetische kaarten en fysieke kaarten twee soorten kaarten die construeren om de genen in chromosomen te tonen. Ze houden zich bezig met genetische diagnostiek en het voorspellen van de evolutie met betrekking tot genoomanalyse. Verder gebruiken ze om de afstanden tussen genloci te analyseren en om gen-polymorfismen te analyseren.

INHOUD

1. Overzicht en belangrijkste verschil
2. Wat is genetische kaart
3. Wat is fysieke kaart
4. Overeenkomsten tussen genetische kaart en fysieke kaart
5. Side-by-side vergelijking - genetische kaart versus fysieke kaart in tabelvorm
6. Samenvatting

Wat is genetische kaart?

Een genetische kaart baseert zich op de genloci-locaties en genetische markers geïdentificeerd door koppelingsanalyse en gen-associatiestudies. Mendeliaanse genetica legt de genetische kaarten uit en Gregor Mendel is de persoon die dit concept introduceerde. Een genetische kaart is nuttig bij het bestuderen van de chromosoomlocaties en de genen die betrokken zijn bij het veroorzaken van bepaalde kenmerken. Deze genen geërfd door de dochter-generaties worden vervolgens geïdentificeerd als genetische markers voor een bepaalde ziekte of een karakter.

Figuur 01: Genetische kaart

Meerdere kweektechnieken gedurende vele generaties en vervolgens het analyseren van de fokpatronen voor een bepaald kenmerk of kenmerk zijn noodzakelijk voordat een genetische kaart wordt samengesteld. En ook ondersteunen gen-associatiestudies de identificatie van verschillende allelen die verantwoordelijk zijn voor specifieke overervingspatronen in genetische cartografie. De allelfrequenties en genfrequenties helpen om de genkaart van een bepaald gen op een chromosoom te voorspellen.

Wat is fysieke kaart?

Fysieke kaarten van genen construeren met behulp van de moleculair biologische technieken zoals restrictie-enzymdigestie, enz. Vandaar, restrictiekaart is een andere naam voor deze kaart. Bij het genereren van een fysieke kaart, knipten restrictie-enzymen in het begin het DNA in fragmenten. Deze fragmenten scheiden vervolgens door middel van gelelektroforese. De volgende stap is het genereren van de fysieke kaart van het DNA. Als een volgende stap kunnen ze worden onderworpen aan blottingstechnieken na de hybridisatie. Op dit moment worden high-throughput-technieken zoals Fluorescentie In situ-hybridisatie gebruikt om fysieke kaarten te genereren voor gebruik als genetische markers..

Figuur 02: Fysieke kaart

Fysieke kaarten zijn nauwkeuriger en sneller in vergelijking met genetische kaarten. Vandaar dat hun gebruik in het analyseren van gen polymorfisme hoog is in vergelijking met genetische kaarten. Fysieke mapping houdt ook geen rekening met Mendeliaanse genetische patronen.

Wat zijn de overeenkomsten tussen genetische kaart en fysieke kaart?

• Beide kaarten hebben betrekking op het karakteriseren van genetische markers.
• Genoomwijde studies maken gebruik van beide kaarten.
• Genetische kaart en fysieke kaart zijn nuttig bij genetische diagnostiek.

Wat is het verschil tussen genetische kaart en fysieke kaart?

Genetic Map is een genmap gebaseerd op genlinking en gen-associatiestudies gedaan op een genetische marker of genloci van een chromosoom. Fysieke kaart is een genkaart waarin de genkaart fysiek wordt verkregen door het DNA te isoleren en de precieze genetische marker te verkrijgen met behulp van moleculaire biologie. Met betrekking tot de technieken die in deze twee kaarten worden gebruikt, is het verschil tussen de genetische kaart en de fysieke kaart dat de genetische kaart gebruik maakt van genkoppelings- en gen-associatieanalysemethoden, terwijl de fysieke kaart restrictiekartering- en hybridisatietechnieken gebruikt. Daarom is de nauwkeurigheid in de genetische kaart laag, terwijl deze hoog is in de fysieke kaart.

Bij het vergelijken van de snelheid van de technieken die in deze twee kaarten worden gebruikt, heeft de genetische kaart minder snelle, tijdrovende technieken. Fysieke kaart heeft echter zeer snelle technieken. Bijgevolg is de genetische kaart minder efficiënt, terwijl de fysieke kaart zeer efficiënt is. Bovendien zijn genetische kaarten gebaseerd op Mendeliaanse overervingspatronen, terwijl fysieke kaarten niet rechtstreeks op Mendeliaanse overervingspatronen zijn.

Samenvatting - Genetische kaart versus fysieke kaart

Genoomonderzoek gebruikt genetische markers die zich in de chromosomen bevinden. Om deze markers te bestuderen, moeten ze met verschillende technieken in kaart worden gebracht. Mendeliaanse genetica is de basis van genetische kaarten. Tijdens de genetische mapping worden verschillende kenmerken gedurende vele generaties bestudeerd en worden de genen geanalyseerd met behulp van gen-koppeling en gen-associatiestudies. Fysieke genkaarten daarentegen hebben betrekking op de fysieke isolatie en karakterisering van genetische markers door deze te extraheren. Dit is het belangrijkste verschil tussen genetische kaart en fysieke kaart.

Referentie:

1.O'Rourke, Jamie A. "Genetische en fysieke kaartcorrelatie." Encyclopedia of Life Sciences, nov. 2014. Beschikbaar Hier   
2. "Fact sheet Genetic Mapping." National Human Genome Research Institute (NHGRI). Beschikbaar Hier 

Afbeelding met dank aan:

1.'File: NHGRI Fact Sheet- Genetic Mapping (27058469495) 'Door National Human Genome Research Institute (NHGRI) uit Bethesda, MD, VS - NHGRI-gegevensblad: Genetic Mapping, (CC BY 2.0) via Commons Wikimedia 
2.'Human chromosome Y - 400 550 850 bphs'By National Centre for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine (Public Domain) via Commons Wikimedia