Verschil tussen stroomopwaarts en stroomafwaarts DNA

Belangrijkste verschil - Stroomopwaarts versus stroomafwaarts DNA
 

Het is belangrijk om algemene kennis te hebben over de samenstelling en structuur van DNA om het verschil tussen stroomopwaarts en stroomafwaarts DNA te begrijpen. DNA is samengesteld uit polynucleotide ketens. Nucleotiden zijn de bouwstenen die polynucleotidenketens vormen en elk nucleotide bestaat uit drie componenten: een suiker met vijf koolstofatomen, een stikstofhoudende base en een fosfaatgroep. Een fosfaatgroep en een OH-groep zijn gehecht aan respectievelijk 5 'positie koolstof en 3' positie koolstof van het suikermolecuul in een nucleotide. Nucleotiden worden samengevoegd door fosfodiesterbindingen gevormd tussen 5'-fosfaatgroep van één nucleotide en 3'-OH-groep van het aangrenzende nucleotide. Als een polynucleotide-keten een vrije 5'-fosfaatgroep heeft, wordt deze als het 5'-uiteinde toegewezen; als het een vrije 3 'OH-groep heeft, wordt het toegewezen als een 3'-uiteinde. Daarom hebben DNA-strengen gewoonlijk 5'- en 3'-uiteinden volgens de eindposities van de polynucleotideketens. DNA bestaat ook als dubbelstrengs vorm. Twee strengen zijn antiparallel aan elkaar. Daarom heeft DNA twee strengen die in de richting van 5 'naar 3' en 3 'naar 5' lopen. Stroomopwaarts en stroomafwaarts DNA wordt verwezen met verwijzing naar transcriptie en synthese van 5 'naar 3'-mRNA-streng. Als DNA wordt beschouwd in de richting van het 5-uiteinde van de coderende streng vanaf de transcriptie-initiatieplaats, is het bekend als stroomopwaarts DNA. Als DNA wordt beschouwd in de richting van het 3'-uiteinde van de coderende streng vanaf de transcriptie-initiatieplaats is dit bekend als stroomafwaarts DNA. Dit is het belangrijkste verschil tussen stroomopwaarts en stroomafwaarts DNA.

INHOUD
1. Overzicht en belangrijkste verschil
2. Wat is stroomopwaarts DNA
3. Wat is stroomafwaarts DNA
4. Vergelijking zij aan zij - Stroomopwaarts versus stroomafwaarts DNA
5. Samenvatting

Wat is stroomopwaarts DNA?

Een gen is een structurele en functionele eenheid-erfelijkheid die zich bevindt op het DNA van een organisme. Het wordt opgeslagen met instructies om een ​​eiwit te construeren. Het gen heeft een specifiek gebied van een DNA-molecuul. Indien nodig transcribeert het en vertaalt het zich in een eiwit via synthese van een mRNA-streng. Normaal loopt een coderende streng van het gen van de 5'- naar de 3'-richting. Wanneer het wordt getranscribeerd, produceert het een mRNA-streng in dezelfde richting 5 'tot 3'. Tijdens de transcriptie wordt 3 'naar 5' antisense streng gediend als de matrijsstreng en initieert de mRNA-synthese. Er is een transcriptie-initiatieplaats in het gen. Met verwijzing naar de transcriptie-initiatieplaats, is het DNA-gebied in de richting van het 5'-uiteinde van de coderende streng bekend als stroomopwaarts DNA. Een promotor van het gen bevindt zich normaal in het stroomopwaartse DNA-gebied. In eukaryote genen zijn er TATA-boxen, promotor-proximale elementen en enhancers in het gebied stroomopwaarts van het gen. Het stroomopwaartse gebied van het gen wordt aangeduid met negatieve getallen. Stroomopwaarts DNA van een gen is van het grootste belang voor de transcriptie.

Wat is stroomafwaarts DNA?

De transcriptie-initiatieplaats staat bekend als +1 punt van een gen. Het DNA-gebied van +1-punt naar het 3'-uiteinde van de coderende streng is bekend als stroomafwaarts DNA. Met andere woorden stroomafwaarts van het gen is van de transcriptie-initiatieplaats naar het 5'-uiteinde van de matrijsstreng. Daarom omvat stroomafwaarts DNA van een gengebied transcriptionele eenheid en andere sequenties zoals terminatorsequentie. De promoter kan de stroomafwaartse sequentie van een gen beïnvloeden. Het stroomafwaartse gedeelte van een gen wordt aangeduid met positieve getallen. Stroomafwaarts DNA van een gen is het feitelijke gebied dat het eiwitproduct geeft.

Figuur 01: Stroomopwaarts en stroomafwaarts DNA

Wat is het verschil tussen stroomopwaarts en stroomafwaarts DNA?

Stroomopwaarts versus stroomafwaarts DNA
DNA-gebied naar het 5'-uiteinde van de coderende sequentie vanaf de transcriptie-initiatieplaats is bekend als stroomopwaarts DNA.	DNA-gebied naar het 3'-uiteinde van de coderende streng vanaf de transcriptie-initiatieplaats is bekend als stroomafwaarts DNA.
Elements
Promoters en enhancers bevinden zich in het stroomopwaartse DNA	De transcriptie-eenheid en de terminatorsequenties bevinden zich in het stroomafwaartse DNA.
nummering
Nucleotiden in het stroomopwaartse gebied worden aangeduid met negatieve getallen	Nucleotiden worden aangeduid met positieve getallen.
Functie
Dit gebied bevat elementen die nodig zijn voor het reguleren en initiëren van transcriptie	Dit gebied bevat instructies om een ​​eiwit te produceren en de transcriptie te beëindigen

Samenvatting - Stroomopwaarts versus stroomafwaarts DNA

Het is gemakkelijk om stroomopwaarts en stroomafwaarts van een RNA-streng te identificeren. Met betrekking tot de referentiesite is het gebied naar het 5'-uiteinde van de RNA-streng bekend als stroomopwaarts RNA, terwijl regio naar het 3'-uiteinde bekend is als stroomafwaarts RNA. In DNA zijn er echter twee strengen die in beide richtingen 5 'tot 3' en 3 'tot 5' lopen. Daarom is het verschil tussen stroomopwaarts en stroomafwaarts DNA gecompliceerd. Daarom is het gedifferentieerd met verwijzing naar de transcriptie van een gen. Van de transcriptie-initiatieplaats naar het 5-uiteinde van de sense streng is het DNA-gebied bekend als stroomopwaarts DNA, terwijl van de transcriptie-initiatieplaats naar het 3'-uiteinde van de sense-streng bekend is als stroomafwaarts DNA. Dit is het verschil tussen stroomopwaarts en stroomafwaarts van DNA.

Referenties:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi en Jonatha M. Gott. "Verschillende rollen voor sequenties stroomopwaarts en stroomafwaarts van Physarumediting-sites." RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, september 2009. Web. 18 maart 2017

Afbeelding met dank aan:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro en Luísa Romão. "Genexpressie-regulatie door upstream open reading frames en menselijke ziekten." PLOS Genetics. Public Library of Science, n.d. Web. 18 maart 2017.