Verschil tussen doelgerichte en niet-doelgerichte proteomics

Het belangrijkste verschil tussen doelgerichte en niet-doelgerichte proteomics is dat het gerichte proteomica is gericht op het meten van de abundantie van een specifiek eiwit, terwijl niet-gerichte proteomica niet op een specifiek eiwit is gericht.

Proteomics is de grootschalige studie van eiwitten, hun structuren en functies. Het bestudeert het volledige eiwit-complement in een cel, weefsel of een organisme onder specifieke omstandigheden. Er zijn twee soorten proteomica als gerichte proteomica en ongerichte proteomica.

INHOUD

1. Overzicht en belangrijkste verschil
2. Wat is Gerichte Proteomics
3. Wat is Untargeted Proteomics
4. Overeenkomsten tussen Gerichte en niet-doelgerichte Proteomics
5. Vergelijking zij aan zij - Gerichte versus niet-getargete proteomics in tabelvorm
6. Samenvatting

Wat is Gerichte Proteomics?

Zoals de naam aangeeft, richt gerichte proteomica zich op een specifiek eiwit of een peptide in een complex mengsel van eiwitten voor analyse. Vervolgens analyseert het de aanwezigheid en de hoeveelheid van dat vooraf geselecteerde specifieke eiwit. Deze methode is alleen mogelijk voor één monster of voor meerdere monsters. Deze methode is zelfs geschikt voor een specifieke groep eiwitten. Het resulteert in meer precieze, kwantitatieve en gevoelige gegevens. Bovendien produceert massaspectrometrie in combinatie met gerichte proteomica nauwkeuriger betrouwbare metingen. Deze methode maakt gebruik van triple quadrupole massaspectrometer (QQQ) voor zijn analyse.

Figuur 01: Proteomics

Gerichte proteomica is een geschikte methode als u wilt nagaan of een knockdown-doel daadwerkelijk is verbroken of als u een bepaald eiwit / peptide in bloedserum, cerebrale vloeistof of in cellysaat wilt kwantificeren. U kunt het ook gebruiken als u dat wilt om te controleren of een bepaald eiwit differentieel wordt uitgedrukt in monsters of tijdens een tijdsverloop.

Wat is Untargeted Proteomics?

Niet-gerichte proteomics, zoals de naam noemt, richt zich niet op een specifiek eiwit of peptide voor zijn analyse. Ontdekking proteomics is een andere naam voor Untargeted proteomics. In feite is het een meer 'globale' analyse. In het algemeen is het uitvoeren van niet-doelgerichte proteomics het beantwoorden van de vraag "welk eiwit of eiwitten zijn in dit monster of meerdere monsters?". Deze methode is niet gevoelig als gerichte proteomics. Maar het kan veel eiwitten identificeren en meten, inclusief nieuwe eiwitten. Niet-gerichte proteomics kan zowel kwantitatieve als kwalitatieve metingen produceren.

Wat zijn de overeenkomsten tussen doelgerichte en niet-doelgerichte proteomics?

• Zowel doelgerichte als niet-doelgerichte proteomics meten eiwitten in monsters.
• Ze zijn belangrijk bij proteoomanalyse.
• Deze methoden maken gebruik van massaspectrometrie.

Wat is het verschil tussen doelgerichte en niet-doelgerichte proteomics?

Ten eerste is gerichte proteomica de bepaling van de aanwezigheid en hoeveelheid van een bepaald eiwit of peptide in een complex mengsel van eiwitten. Daarentegen is niet-gerichte proteomica de kwantitatieve en kwalitatieve studie van eiwitten die in een monster of monsters aanwezig zijn zonder een bepaald eiwit te targeten. Gerichte proteomics wordt uitgevoerd met vooraf geselecteerde of gerichte eiwitten, terwijl niet-gerichte proteomics wordt uitgevoerd om de soorten eiwitten in dit monster te achterhalen. Bovendien is gerichte proteomica gevoeliger dan ongerichte proteomics.

Samenvatting - Gerichte versus niet-getargete proteomics

Samenvattend, doelgerichte en niet-doelgerichte proteomics zijn twee soorten eiwitstudies. Zoals hun namen suggereren, richt gerichte proteomica zich op een specifiek eiwit, terwijl niet-gerichte proteomica niet op een specifiek eiwit is gericht. Dit is het verschil tussen gerichte en niet-doelgerichte proteomics.

Referentie:

1. "Gerichte Proteomics." UC Davis Proteomics Core, Beschikbaar Hier.
2. "Proteomics / Introduction to Proteomics." Music Theory / Modes - Wikibooks, Open Books for a Open World, Beschikbaar Hier.

Afbeelding met dank aan:

1. "Proteomics" By Xxl7441 bij English Wikibooks - Overgezet van en.wikibooks naar Commons (Public Domain) via Commons Wikimedia