Verschil tussen motief en domein

De belangrijk verschil tussen motief en domein is dat het motief is niet onafhankelijk stabiel terwijl het domein onafhankelijk stabiel is.

Eiwitten zijn belangrijke biologische macromoleculen die in ons lichaam aanwezig zijn. Aan de andere kant zal de genetische code van een gen de aminozuursequentie van een eiwit bepalen. Bovendien hebben eiwitten primaire, secundaire en tertiaire structuren. De primaire structuur is de aminozuursequentie van de polypeptideketen. Wanneer polypeptideketens met elkaar vouwen, vormt het de secundaire structuur van het eiwit. Alfa-helices, beta-vellen en super-secundaire structuren behoren tot de secundaire structuren. Bepaalde groeperingen van super-secundaire elementen staan ​​bekend als eiwitmotieven. De tertiaire structuur van een eiwit verwijst naar zijn driedimensionale structuur die de functie van het eiwit bepaalt. Domein is een gevouwen gedeelte van een eiwitmolecuul, dat bolvormig is en een discrete functie heeft. Het is de fundamentele functionele en driedimensionale structuur van het eiwit.

INHOUD

1. Overzicht en belangrijkste verschil
2. Wat is motief
3. Wat is domein
4. Overeenkomsten tussen motief en domein
5. Vergelijking zij aan zij - Motief vs domein in tabelvorm
6. Samenvatting

Wat is motief?

Motief is een bepaalde groepering van de super secundaire elementen van eiwitten zoals alfa-helices en bètastructuren. Het zijn patronen in verschillende eiwitten. Motieven beschrijven de vouwpatronen van de secundaire structurele elementen en hun interacties. Deze vouwpatronen stabiliseren door vergelijkbare koppelingen die aanwezig zijn in tertiaire structuren. Ze zijn echter niet zo complex als tertiaire structuren.

Figuur 01: Motief

Het zijn eenvoudige combinaties van secundaire structuren van eiwitten. Motief is niet alleen stabiel. Bovendien verklaren motieven de structuur van een eiwit maar voorspellen ze niet de functie van een eiwit. Voorbeelden van eiwitmotieven zijn een bèta-alfa-bèta-motief, een Grieks sleutelmotief, een bètakubus, een bèta-meandermotief, enz..

Wat is domein?

Domein is een fundamentele, functionele en driedimensionale eenheid van een eiwit. Het voert een specifieke functie uit. Een enkel eiwit kan verschillende verschillende domeinen hebben. Elk domein is een onafhankelijke eenheid. Het is een bolvormige structuur. Het is verantwoordelijk voor een specifieke functie of interactie. Domeinen kunnen worden gebruikt om de functie van een niet-gekarakteriseerd eiwit te hypothetiseren. Bij het analyseren van een eiwit is het essentieel om rekening te houden omdat domeinen de functionele eenheden van het eiwit zijn.

Figuur 02: Drie verschillende domeinen van pyruvaatkinase

Domeinen zijn zeer stabiele en compacte structuren. Ze kunnen gemakkelijk worden onderscheiden van andere regio's. Pyruvaat-kinase heeft drie verschillende domeinen, zoals weergegeven in figuur 02. De lengte van het domein kan variëren en de gemiddelde lengte is 100 aminozuren. Elk domein bevat een hydrofobe kern opgebouwd uit secundaire structurele eenheden. Verschillende domeinen vormen samen de tertiaire structuur van een eiwit.

Wat zijn de overeenkomsten tussen motief en domein?

• Motief en domein zijn eenheden die in eiwitmoleculen zelf aanwezig zijn.
• Ze zijn handig bij het classificeren van eiwitfamilies.

Wat is het verschil tussen motief en domein?

Motief is een bepaalde groepering van de super secundaire elementen van eiwitten zoals alfa-helices en betastructuren, terwijl domein de functionele eenheid van een eiwit is. Verder is het motief een secundaire structuur, terwijl het domein verantwoordelijk is voor de tertiaire structuur van het eiwit. Bovendien is domein een onafhankelijke eenheid, in tegenstelling tot een motief. Ook toont het domein de functie van een eiwit terwijl motief dat niet is. Dit zijn de belangrijkste verschillen tussen motief en domein. De onderstaande infographic presenteert het verschil tussen motief en domein in tabelvorm.

Samenvatting - Motief versus domein

Motief is een rangschikking van secundaire structuren van het eiwitmolecuul. Het is meestal niet stabiel op zichzelf, in tegenstelling tot een domein. Domein is een onafhankelijk stabiele structuur van een eiwit. Daarom kan het een deel of geheel eiwitmolecuul zijn. Het is een driedimensionale fundamentele functionele eenheid van het eiwit. Bovendien heeft het een functie en is het een onafhankelijke eenheid. Motief kan een deel van het domein zijn. Maar domein kan geen deel uitmaken van een motief. Dit is het verschil tussen motief en domein.

Referentie:

1. "Protein Domain." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 31 juli 2018. Beschikbaar Hier

Afbeelding met dank aan:

1. "Anthrax-toxine-eiwit sleutelmotief" door NatelewisDerivative werk (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia
2. "Pyruvate kinase protein domeinen" door Thomas Splettstoesser - eigen werk, (CC BY-SA 3.0) via Commons Wikimedia