siRNA vs miRNA
RNA's zijn zeer belangrijke moleculen, die helpen om het leven van organismen op te bouwen. Onlangs hebben wetenschappers kleine RNA's ontdekt die worden genoemd RNA-interferentie of RNAi, die na de transcriptie werken om genexpressie te reguleren. De twee belangrijkste soorten kleine RNA's zijn micro RNA of miRNA en klein interfererend RNA of siRNA. Deze moleculen reguleren in principe de genexpressie door het doelgen te onderdrukken. Zowel miRNA als siRNA hebben zeer vergelijkbare biogenese-routes, hoewel er enkele verschillen tussen hen bestaan. De oorsprong van miRNA en siRNA zijn van dsRNA-moleculen. Volwassen miRNA's zijn structureel vergelijkbaar met siRNA-moleculen.
miRNA
Micro-RNA's of miRNA's zijn de kleine RNA-moleculen die de laatste controle van translationele genregulatie veroorzaken. Deregulering van miRNA kan leiden tot de ontwikkeling van kanker en andere ziekten. Daarom is de juiste regulatie van informatie gecodeerd in het niet-coderende gebied van miRNA zeer kritisch in veel fundamentele cellulaire processen.
siRNA
siRNA's worden ook wel aangeduid als kort interfererend of silencing-RNA en zijn gemaakt van dubbelstrengig RNA met 20 tot 25 basenparen. De belangrijkste rol van siRNA is om te interfereren met de expressie van specifieke genen met complementaire nucleotidesequenties. siRNA bestaat uit kort dubbelstrengig RNA met gefosforyleerde 5'-uiteinden en gehydroxyleerde 3'-uiteinden met twee overhangende nucleotiden.
Wat is het verschil tussen siRNA en miRNA?
• miRNA afgeleid van specifieke genomische loci, terwijl siRNA afgeleid is van mRNA, transposons, virussen of heterochromatisch DNA.
• Synthese van miRNA wordt verwerkt uit langere voorloper haarspeldtranscripten (primaire nucleaire miRNA-sequentie door RNase III-endonuclease), terwijl die van siRNA verwerkt uit lange bimoleculaire RNA-duplexen.
• Elk miRNA-haarspeld-precursormolecuul produceert één miRNA-duplex, terwijl elk siRNA-precursormolecuul meerdere siRNA-duplexen produceert.
• siRNA-sequenties zijn zelden geconserveerd, terwijl miRNA-sequenties goed geconserveerd zijn.
• Alle basen binnen siRNA dragen bij aan de doelspecificiteit ervan, terwijl slechts 5% van de miRNA bijdraagt aan zijn doelspecificiteit.
• miRNA binden vaak aan het 3'-niet-getranslateerde gebied van doeltranscripten, terwijl siRNA's overal complementaire duplex langs een doel-mRNA vormen.
• miRNA specificeert 'hetero-uitschakeling' terwijl siRNA werd gebruikt voor 'auto silencing'.
• miRNA werkt als een signaal om vertaling te voorkomen, terwijl siRNA fysiek translatie voorkomt.